124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0214 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  81.9 
 
 		 219 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  79.26 
 
 		 219 aa  361  6e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  79.26 
 
 		 219 aa  361  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  79.26 
 
 		 219 aa  361  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  77.73 
 
 		 226 aa  357  9e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  76.61 
 
 		 223 aa  348  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  79.52 
 
 		 221 aa  345  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  78.34 
 
 		 219 aa  344  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  75.34 
 
 		 219 aa  344  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  76.61 
 
 		 222 aa  344  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  77.42 
 
 		 219 aa  342  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  77.21 
 
 		 217 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  77.21 
 
 		 217 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  77.21 
 
 		 217 aa  338  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  75.24 
 
 		 219 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  74.41 
 
 		 219 aa  326  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  63.03 
 
 		 224 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  63.9 
 
 		 223 aa  274  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  62.79 
 
 		 245 aa  274  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  60 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  58.99 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  61.01 
 
 		 225 aa  264  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  59.17 
 
 		 224 aa  263  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  61.72 
 
 		 225 aa  261  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  60 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  56.16 
 
 		 236 aa  254  5e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  59.31 
 
 		 222 aa  248  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  57.67 
 
 		 222 aa  246  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  57.67 
 
 		 222 aa  246  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  57.14 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  57.67 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  59.31 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  57.14 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  56.22 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  56.22 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  57.21 
 
 		 221 aa  244  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.114304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  55.76 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  55.76 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  55.76 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  55.76 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  55.76 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  55.76 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  56.54 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  56.54 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  56.54 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  56.07 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  55.76 
 
 		 221 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  56.54 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  56.54 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  56.78 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  55.98 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  48.15 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  47.62 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  34.38 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  34.38 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  34.08 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  38.18 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  38.1 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  37.27 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  42.95 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  31.75 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  41.22 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  43.06 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  35.48 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  41.77 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  41.77 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  34.68 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  41.98 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  31.16 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  33.51 
 
 		 186 aa  86.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  32 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  30.86 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  28.41 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  29.52 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  29.52 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  30.77 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  33.08 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  25.93 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  31.54 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  25.81 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  26.98 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  29.69 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  26.4 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  28.93 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  29.05 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  27.44 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  29.07 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  32.03 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  27.33 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  29.23 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  32.81 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  32.81 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  28.46 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  25.17 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  22.22 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  29.89 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  29.89 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>