More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1795 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  78.15 
 
 
389 aa  643    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  794    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  72.94 
 
 
388 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  74.74 
 
 
389 aa  611  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  73.45 
 
 
388 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  74.42 
 
 
391 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.16 
 
 
388 aa  607  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  72.68 
 
 
388 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  72.09 
 
 
395 aa  605  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.68 
 
 
388 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  71.13 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  70.88 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  70.88 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  70.88 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  71.13 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  71.91 
 
 
388 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.39 
 
 
388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  70.88 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.39 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 
388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.36 
 
 
388 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  70.88 
 
 
388 aa  597  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.36 
 
 
388 aa  597  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.39 
 
 
388 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  70.36 
 
 
397 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.39 
 
 
388 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  70.36 
 
 
388 aa  593  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.88 
 
 
388 aa  591  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  70.1 
 
 
388 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.81 
 
 
387 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70 
 
 
390 aa  584  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  71.39 
 
 
388 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.69 
 
 
389 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.07 
 
 
388 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.33 
 
 
409 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  68.56 
 
 
387 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  69.33 
 
 
388 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  68.3 
 
 
388 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.81 
 
 
409 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  69.07 
 
 
409 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.56 
 
 
387 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.3 
 
 
388 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.3 
 
 
387 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  67.78 
 
 
387 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.04 
 
 
397 aa  548  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  63.4 
 
 
388 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.3 
 
 
391 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.54 
 
 
398 aa  539  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  65.38 
 
 
389 aa  537  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  61.03 
 
 
491 aa  511  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  59.45 
 
 
397 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.51 
 
 
388 aa  474  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.84 
 
 
372 aa  432  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  51.78 
 
 
422 aa  424  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  44.99 
 
 
389 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  44.99 
 
 
389 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.99 
 
 
389 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.44 
 
 
442 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  31.35 
 
 
447 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  31.15 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 
435 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.46 
 
 
451 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.61 
 
 
427 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.69 
 
 
451 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  33.79 
 
 
434 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.51 
 
 
450 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.8 
 
 
441 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  31.31 
 
 
473 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.05 
 
 
462 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.05 
 
 
462 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.98 
 
 
441 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.05 
 
 
441 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  29.72 
 
 
466 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.05 
 
 
456 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.05 
 
 
462 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  31.61 
 
 
443 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  33.52 
 
 
438 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.28 
 
 
437 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 
456 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  33.24 
 
 
438 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.78 
 
 
453 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  33.24 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.05 
 
 
456 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  33.06 
 
 
452 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  31.98 
 
 
450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  30.19 
 
 
440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  30 
 
 
467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.7 
 
 
467 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  30.2 
 
 
449 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  30.2 
 
 
449 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.79 
 
 
467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.97 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  29.78 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  32.51 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.18 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  32.97 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  32.04 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  30.79 
 
 
427 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>