More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1461 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0531  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  45.29 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  45.29 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  41.89 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.29 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.29 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.29 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.84 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.84 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.84 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3780  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3235  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.40462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.09 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.41 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.41 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.41 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  45.45 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  41.96 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.95 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.5 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.95 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  41.07 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  41.07 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  41.52 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.5 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  41.07 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  41.07 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  41.07 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  41.07 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  41.07 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.5 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  46.15 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  42.48 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  43.36 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.55 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  44.8 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000321608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.39 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  38.84 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  40.18 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4238  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.54 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>