More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0818 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0818  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
590 aa  1203    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 
530 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 
656 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  29.3 
 
 
621 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  28.48 
 
 
566 aa  127  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  29.65 
 
 
536 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  28.76 
 
 
661 aa  124  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  41.71 
 
 
533 aa  123  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 
652 aa  123  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 
650 aa  123  9e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 
658 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.72 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 
546 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 
380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  26.69 
 
 
656 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.46 
 
 
563 aa  122  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 
682 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.42 
 
 
663 aa  121  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293812  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  24.38 
 
 
625 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  28.65 
 
 
593 aa  118  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 
650 aa  118  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  28.65 
 
 
584 aa  118  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 
563 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  30.69 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  24.2 
 
 
627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.24 
 
 
680 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 
633 aa  115  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  30.09 
 
 
708 aa  115  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 
563 aa  114  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.29 
 
 
583 aa  114  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  30.72 
 
 
600 aa  113  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5093  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 
676 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
713 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  29.36 
 
 
538 aa  112  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001512  aerotaxis sensor receptor protein  32.46 
 
 
516 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.961146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 
411 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0916  methyl-accepting chemotaxis protein  28.4 
 
 
543 aa  111  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5554  methyl-accepting chemotaxis protein  31.15 
 
 
676 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
545 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
545 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.07 
 
 
545 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
545 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  54.05 
 
 
666 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  29.75 
 
 
690 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 
545 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.09 
 
 
543 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  35.79 
 
 
626 aa  108  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
442 aa  108  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 
676 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.95 
 
 
705 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
775 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  29.23 
 
 
568 aa  107  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 
663 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 
572 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.89 
 
 
430 aa  107  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 
388 aa  107  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.1 
 
 
546 aa  107  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 
543 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  29.45 
 
 
716 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.86 
 
 
539 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.29 
 
 
564 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.18 
 
 
705 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.807181  normal  0.137814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 
545 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 
423 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.14 
 
 
666 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  47.24 
 
 
655 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.96 
 
 
706 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.96 
 
 
706 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  47.24 
 
 
655 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.98 
 
 
668 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.22 
 
 
706 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1060  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  30.43 
 
 
673 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  28.69 
 
 
578 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.9 
 
 
670 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.97 
 
 
678 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.8 
 
 
687 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0662  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 
626 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436733  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  33.45 
 
 
720 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  29.39 
 
 
660 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 
543 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 
543 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 
539 aa  104  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 
738 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58650  putative chemotaxis transducer  29.76 
 
 
673 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 
540 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 
539 aa  104  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 
543 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.25 
 
 
582 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  hitchhiker  0.00410847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  30.24 
 
 
545 aa  103  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.37 
 
 
693 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
666 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2474  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 
552 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 
538 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.8 
 
 
638 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  29.14 
 
 
650 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.2 
 
 
672 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  30.47 
 
 
497 aa  103  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 
702 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.72 
 
 
558 aa  103  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  48 
 
 
651 aa  103  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>