More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0634 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  100 
 
 
421 aa  865    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  58.07 
 
 
442 aa  501  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  54.18 
 
 
426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  53.24 
 
 
441 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  52.74 
 
 
421 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  54.65 
 
 
422 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  54.42 
 
 
422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  53.28 
 
 
442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  54.42 
 
 
422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  46.27 
 
 
433 aa  398  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  40.27 
 
 
551 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  36.95 
 
 
570 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  36.79 
 
 
499 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  37.25 
 
 
495 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  36.34 
 
 
492 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  37.64 
 
 
570 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  35.8 
 
 
499 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  37.44 
 
 
557 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  36.32 
 
 
568 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  36.32 
 
 
573 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  36.32 
 
 
570 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  36.43 
 
 
571 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  35.81 
 
 
494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  34.28 
 
 
502 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  34.11 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  33.57 
 
 
473 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  33.26 
 
 
491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  31.37 
 
 
495 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  26.71 
 
 
501 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  27.73 
 
 
442 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  26.57 
 
 
452 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  26.25 
 
 
896 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  27.23 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.05 
 
 
404 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.29 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  27.36 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  25.42 
 
 
413 aa  111  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  25.29 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.36 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.27 
 
 
406 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.54 
 
 
413 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.54 
 
 
413 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  26.56 
 
 
414 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.19 
 
 
885 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.16 
 
 
419 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.59 
 
 
406 aa  107  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.57 
 
 
412 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.08 
 
 
406 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.18 
 
 
414 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.3 
 
 
414 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  29.14 
 
 
879 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  26.44 
 
 
414 aa  103  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.08 
 
 
406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  27.18 
 
 
420 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.06 
 
 
414 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.42 
 
 
392 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.02 
 
 
430 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  28.48 
 
 
428 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.08 
 
 
406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.08 
 
 
406 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.63 
 
 
417 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.08 
 
 
406 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  26.85 
 
 
406 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  26.85 
 
 
406 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  26.85 
 
 
406 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.29 
 
 
433 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.08 
 
 
406 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  25.18 
 
 
405 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.36 
 
 
434 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  27.13 
 
 
395 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  28.15 
 
 
428 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.04 
 
 
406 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.36 
 
 
412 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.84 
 
 
403 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.51 
 
 
878 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.84 
 
 
429 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.27 
 
 
406 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  25.18 
 
 
421 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.29 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  27.88 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.12 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.52 
 
 
417 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.71 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.29 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  28.17 
 
 
441 aa  96.7  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  24.76 
 
 
424 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.12 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.48 
 
 
419 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.6 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.95 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.58 
 
 
418 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  26.42 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.76 
 
 
408 aa  95.5  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  25.48 
 
 
410 aa  95.5  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  25.47 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  24.7 
 
 
429 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.76 
 
 
408 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  26.18 
 
 
405 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  25.65 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.53 
 
 
404 aa  93.6  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>