More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2039 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  99.6 
 
 
248 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  98.79 
 
 
248 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  98.79 
 
 
248 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  96.37 
 
 
248 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  91.13 
 
 
248 aa  470  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  91.13 
 
 
248 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  91.13 
 
 
248 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  91.13 
 
 
248 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  82.19 
 
 
248 aa  421  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  82.19 
 
 
248 aa  417  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  82.59 
 
 
248 aa  417  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  80.16 
 
 
250 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  80.16 
 
 
247 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  81.78 
 
 
248 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  74.9 
 
 
248 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  73.28 
 
 
248 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  73.68 
 
 
247 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  73.66 
 
 
247 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  72.06 
 
 
247 aa  363  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  72.06 
 
 
247 aa  363  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  71.66 
 
 
247 aa  363  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  71.66 
 
 
247 aa  361  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  72.43 
 
 
247 aa  361  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  70.45 
 
 
247 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  68.42 
 
 
246 aa  351  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  68.42 
 
 
246 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  68.42 
 
 
246 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  68.02 
 
 
246 aa  349  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  67.34 
 
 
248 aa  349  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  68.42 
 
 
246 aa  349  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  68.42 
 
 
246 aa  349  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  68.02 
 
 
246 aa  349  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  68.42 
 
 
246 aa  349  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  68.02 
 
 
246 aa  349  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  68.02 
 
 
246 aa  349  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  68.42 
 
 
246 aa  349  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  68.02 
 
 
246 aa  348  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  68.02 
 
 
246 aa  348  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  67.61 
 
 
246 aa  348  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  66.53 
 
 
248 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  68.83 
 
 
246 aa  344  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  65.73 
 
 
248 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  64.92 
 
 
248 aa  340  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  64.92 
 
 
249 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  64.52 
 
 
248 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  64.11 
 
 
248 aa  331  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  65.73 
 
 
248 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  65.73 
 
 
248 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  65.32 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  62.1 
 
 
248 aa  322  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  60.48 
 
 
248 aa  318  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  61.45 
 
 
249 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  61.94 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  62.6 
 
 
246 aa  311  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  64.37 
 
 
249 aa  310  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  62.45 
 
 
250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  62.76 
 
 
240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  58.61 
 
 
244 aa  301  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  58.61 
 
 
244 aa  301  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  61.32 
 
 
245 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  58.92 
 
 
241 aa  288  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  58.47 
 
 
249 aa  288  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  59.04 
 
 
248 aa  287  9e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  57.09 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  57.09 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  56.28 
 
 
247 aa  284  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  56.28 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  59.27 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  55.47 
 
 
247 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  59.27 
 
 
249 aa  281  7.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  56.9 
 
 
241 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  56.2 
 
 
247 aa  278  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  54.25 
 
 
247 aa  278  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  54.66 
 
 
247 aa  278  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  55.65 
 
 
239 aa  277  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  53.85 
 
 
247 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  55.06 
 
 
247 aa  275  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  56.07 
 
 
239 aa  275  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  56.07 
 
 
239 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  55.06 
 
 
247 aa  274  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  53.44 
 
 
247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  56.49 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  55.23 
 
 
239 aa  272  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  59.5 
 
 
242 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  55.56 
 
 
243 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  59.5 
 
 
242 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  56.07 
 
 
239 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  54 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  53.39 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  53.82 
 
 
250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  53.01 
 
 
250 aa  266  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  52.63 
 
 
248 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  58.51 
 
 
241 aa  265  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  56.02 
 
 
241 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  53.69 
 
 
246 aa  261  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4067  hypothetical protein  53.11 
 
 
241 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.751245  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2064  hypothetical protein  58.26 
 
 
242 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  57.44 
 
 
242 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  57.44 
 
 
242 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>