More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0056 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0056  two component transcriptional regulator  100 
 
 
229 aa  460  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  7.25059e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4303  two component transcriptional regulator  97.82 
 
 
229 aa  453  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.205089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0055  two component transcriptional regulator, winged helix family  97.82 
 
 
229 aa  452  1e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0048  two component transcriptional regulator  85.15 
 
 
229 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0059  transcriptional regulatory protein KdpE  81.94 
 
 
229 aa  377  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  80.62 
 
 
229 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76822e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  81.06 
 
 
229 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  80.18 
 
 
229 aa  374  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52099e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0051  two component transcriptional regulator  80.62 
 
 
229 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001287  DNA-binding response regulator KdpE  70.98 
 
 
232 aa  325  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.297598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4479  two component transcriptional regulator  66.37 
 
 
229 aa  294  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.874583  hitchhiker  1.45831e-09 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.98 
 
 
230 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 
241 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 
231 aa  212  3e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 
231 aa  212  4e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  46.82 
 
 
230 aa  212  5e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  47.06 
 
 
231 aa  211  5e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  48 
 
 
232 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 
231 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  46.19 
 
 
230 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  46.4 
 
 
230 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
227 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 
228 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  43.95 
 
 
244 aa  195  4e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  42.98 
 
 
244 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 
228 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
231 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 
233 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 
231 aa  183  2e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  41.89 
 
 
234 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  41.89 
 
 
234 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  41.89 
 
 
234 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  41.89 
 
 
232 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  41.89 
 
 
234 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  41.89 
 
 
232 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 
231 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  41.89 
 
 
234 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
232 aa  182  4e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 
230 aa  182  4e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
237 aa  181  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.62 
 
 
226 aa  181  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  41.89 
 
 
234 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 
232 aa  181  8e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.72 
 
 
225 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.72 
 
 
225 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  42.79 
 
 
234 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
231 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.72 
 
 
225 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.72 
 
 
225 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.18 
 
 
229 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.44 
 
 
231 aa  179  3e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.20296e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04383  two-component system regulatory protein  42.61 
 
 
226 aa  179  3e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 
231 aa  179  3e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.72 
 
 
225 aa  179  3e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 
230 aa  179  3e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.07 
 
 
226 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
230 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 
234 aa  178  5e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 
234 aa  178  5e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 
248 aa  178  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 
228 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 
230 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.14 
 
 
230 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
230 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 
230 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 
228 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
232 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 
235 aa  175  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.37 
 
 
229 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  40.09 
 
 
231 aa  174  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 
232 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 
236 aa  174  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 
232 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 
232 aa  174  1e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 
230 aa  174  1e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
232 aa  173  2e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.27 
 
 
225 aa  173  2e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.27 
 
 
225 aa  173  2e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 
232 aa  173  3e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 
232 aa  173  3e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 
232 aa  173  3e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.27 
 
 
225 aa  172  3e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  39.82 
 
 
229 aa  172  3e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.27 
 
 
225 aa  172  3e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 
232 aa  172  4e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.58 
 
 
209 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.03864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.58 
 
 
209 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 
225 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.27 
 
 
225 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.58 
 
 
209 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  40.81 
 
 
231 aa  172  6e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  40.27 
 
 
225 aa  171  7e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  40.27 
 
 
225 aa  171  7e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
225 aa  170  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  42.15 
 
 
228 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  39.91 
 
 
234 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 
231 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 
232 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  37.5 
 
 
230 aa  169  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  41.07 
 
 
224 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>