More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001287 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001287  DNA-binding response regulator KdpE  100 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.297598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0056  two component transcriptional regulator  70.98 
 
 		 229 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000725059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0055  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.54 
 
 		 229 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4303  two component transcriptional regulator  70.09 
 
 		 229 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.205089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0051  two component transcriptional regulator  70.22 
 
 		 229 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  68.44 
 
 		 229 aa  318  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0059  transcriptional regulatory protein KdpE  69.2 
 
 		 229 aa  318  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  68 
 
 		 229 aa  317  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0048  two component transcriptional regulator  68.3 
 
 		 229 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  68 
 
 		 229 aa  316  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4479  two component transcriptional regulator  62.5 
 
 		 229 aa  296  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.874583  hitchhiker  0.00000000145831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.99 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  41.96 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  43.67 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  42.41 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  41.96 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  43.64 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04383  two-component system regulatory protein  42.79 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  40.62 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 240 aa  171  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  43.36 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.56 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  41.2 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  37.61 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.67 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3763  two component transcriptional regulator  40.42 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 248 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  39.91 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  39.01 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.07 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.07 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  41.07 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  41.07 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.22 
 
 		 226 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.07 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4238  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  39.65 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.66 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1464  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.81 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  40.81 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.18 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.18 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.38 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  36.64 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.55 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0531  two component transcriptional regulator  30.84 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 243 aa  154  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  37.39 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>