248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0801 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  88.22 
 
 
416 aa  707  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.93356e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02052  hypothetical protein  99.76 
 
 
416 aa  806  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  87.98 
 
 
415 aa  699  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0801  nucleoside transporter, NupC family  100 
 
 
416 aa  808  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  88.22 
 
 
416 aa  705  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  88.7 
 
 
416 aa  710  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  88.94 
 
 
416 aa  712  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3300  nucleoside transporter, NupC family  99.28 
 
 
416 aa  801  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00807637  normal  0.0252399 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  88.22 
 
 
416 aa  706  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2311  NupC family nucleoside transporter  99.76 
 
 
416 aa  807  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.000255025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  88.22 
 
 
416 aa  705  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02093  predicted nucleoside transporter  99.76 
 
 
416 aa  806  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1484  nucleoside transporter  100 
 
 
416 aa  808  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125327  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  88.46 
 
 
416 aa  707  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  98.32 
 
 
416 aa  798  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1494  nucleoside transporter  100 
 
 
416 aa  808  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.432303  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  57.48 
 
 
425 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  57.24 
 
 
425 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  55.19 
 
 
424 aa  453  1e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  55.19 
 
 
424 aa  453  1e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  55.19 
 
 
424 aa  453  1e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  55.19 
 
 
424 aa  451  1e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  54.95 
 
 
424 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  54.25 
 
 
426 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  54.95 
 
 
566 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  54.14 
 
 
424 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  54.61 
 
 
424 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  54.61 
 
 
424 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  54.61 
 
 
424 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.55 
 
 
413 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  49.88 
 
 
427 aa  408  1e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  47.75 
 
 
422 aa  405  1e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  52.99 
 
 
416 aa  401  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  49.53 
 
 
422 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  52.99 
 
 
416 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  52.47 
 
 
427 aa  400  1e-110  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  49.53 
 
 
422 aa  399  1e-110  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  52 
 
 
427 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.61858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  47.65 
 
 
420 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  52.42 
 
 
416 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  51.67 
 
 
419 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  51.15 
 
 
415 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  49.41 
 
 
420 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.39256e-10  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  49.41 
 
 
420 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.84803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  48.59 
 
 
419 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.83947e-06  hitchhiker  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  50.12 
 
 
425 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  50.96 
 
 
418 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.24283e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  49.51 
 
 
403 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  49.06 
 
 
419 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.62905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  49.51 
 
 
402 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  49.77 
 
 
419 aa  362  9e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.01153e-05  unclonable  2.54337e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  49.53 
 
 
419 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.93425e-05  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  49.3 
 
 
419 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.7854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  49.77 
 
 
419 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.52943e-08  unclonable  1.04739e-10 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  49.77 
 
 
419 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.65727e-08  hitchhiker  5.17288e-10 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  49.17 
 
 
423 aa  359  6e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  47.22 
 
 
416 aa  357  1e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  50.12 
 
 
419 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.31174e-08  unclonable  5.78399e-12 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  49.06 
 
 
419 aa  356  3e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  4.73709e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  49.3 
 
 
419 aa  356  4e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.94256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  49.3 
 
 
419 aa  356  4e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.90778e-07  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  48.94 
 
 
423 aa  356  4e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  48.94 
 
 
423 aa  356  4e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  46.41 
 
 
420 aa  355  6e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  47.23 
 
 
414 aa  355  6e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  50.12 
 
 
425 aa  355  8e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  45.91 
 
 
402 aa  352  8e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.13486e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  45.93 
 
 
417 aa  352  9e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  48.83 
 
 
419 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  5.46598e-08  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  50.35 
 
 
425 aa  350  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  47.38 
 
 
432 aa  349  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  48.59 
 
 
419 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.98644e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0289  Na+ dependent nucleoside transporter  48.35 
 
 
416 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  44.71 
 
 
404 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  44.16 
 
 
418 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  44.34 
 
 
406 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  43.27 
 
 
406 aa  338  8e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  46.28 
 
 
414 aa  337  2e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  44.39 
 
 
402 aa  335  8e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  44.42 
 
 
408 aa  330  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  45.32 
 
 
408 aa  330  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  40.48 
 
 
402 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  42.07 
 
 
403 aa  326  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  42.17 
 
 
402 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  42.82 
 
 
403 aa  320  2e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.45183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  41.65 
 
 
405 aa  320  2e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  40.92 
 
 
402 aa  321  2e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  39.39 
 
 
419 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  40.92 
 
 
402 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  40.92 
 
 
402 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.92 
 
 
402 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  42.68 
 
 
403 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.34447e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  42.2 
 
 
403 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.23055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  43.1 
 
 
401 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  43.41 
 
 
408 aa  315  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  43.66 
 
 
408 aa  315  1e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  43.51 
 
 
415 aa  310  3e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  41.85 
 
 
403 aa  309  7e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.31054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  41.23 
 
 
417 aa  308  2e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  40.44 
 
 
399 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>