249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1337 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1337  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.617468  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1363  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 
237 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0844  transcriptional regulator, putative  69.79 
 
 
237 aa  344  5e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
241 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
246 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 
243 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 
243 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
244 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  23.5 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  25.43 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  24.56 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  24.3 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  24 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  22.32 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  22.03 
 
 
246 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  23.24 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
249 aa  58.9  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  23.79 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  22.98 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.67 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  21.3 
 
 
245 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  23.47 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  21.23 
 
 
248 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  21.23 
 
 
243 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  21.23 
 
 
243 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  21.23 
 
 
243 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  21.23 
 
 
243 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03974  predicted DNA-binding transcriptional regulator of phosphonate uptake and biodegradation  25.7 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3889  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.7 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3924  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.7 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03934  hypothetical protein  25.7 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4568  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.7 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  21.23 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4656  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.7 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  23.08 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5615  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.23 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  25.26 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4343  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.23 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  22.33 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
264 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
241 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  22.43 
 
 
277 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
245 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  24.57 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  20.18 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  23.29 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  21.84 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  22.69 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>