57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2330 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  708    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  65.31 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  57.58 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  44.34 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  45.73 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  45.77 
 
 		 346 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  45.35 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  41.77 
 
 		 361 aa  255  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  43.4 
 
 		 347 aa  252  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  41.95 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  43.03 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  42.21 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  42.86 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  41.16 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  42.07 
 
 		 350 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  31.52 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  32.63 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.57 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.12 
 
 		 344 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  32.21 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  27.49 
 
 		 471 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  30.09 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  30.27 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  31.52 
 
 		 348 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  25.9 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  23.38 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  24.24 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  22.64 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  22.54 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  23.06 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  20.67 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  25.15 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  20.95 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  26.47 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  23.6 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  25.55 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  26.67 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  28.42 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  21.51 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  29.93 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  23.71 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  27.83 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  25.44 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2715  hypothetical protein  24.74 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  23.53 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  27.21 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  28.65 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  28.65 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  24.79 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  28.07 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  23.64 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  25.94 
 
 		 406 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  21.57 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  20.13 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  24.87 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  25.47 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>