More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1812 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.32 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  57.42 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  55.86 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  58.47 
 
 		 259 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  60.7 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  59.26 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  42.95 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  47.93 
 
 		 262 aa  225  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  46.9 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  46.9 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.68 
 
 		 233 aa  215  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  41.81 
 
 		 315 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  41.47 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  42.29 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  42.29 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  43.08 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  40.85 
 
 		 318 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  41.37 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  39.27 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  39.27 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  38.62 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.65 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  40.43 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.71 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.31 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  45.45 
 
 		 495 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.67 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  39.52 
 
 		 262 aa  154  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  38.84 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  38.89 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  37.65 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  38.26 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.25 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.67 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  38.46 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.35 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.35 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  37.75 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  37.15 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  39.21 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  41 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  39.13 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  37.45 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.7 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  37.01 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.76 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  37.35 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  35.6 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.76 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.3 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  35.71 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  39.04 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  40.2 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  39.92 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  37.19 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  38.6 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.32 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  36.55 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  37.18 
 
 		 215 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.4 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.4 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.59 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.4 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.4 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.4 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  45.57 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.8 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.8 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.58 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  34.96 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  37.88 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  36.95 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  34.4 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  38 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  37.6 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  35.95 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.68 
 
 		 517 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.33 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.65 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.16 
 
 		 297 aa  99.4  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.65 
 
 		 297 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.65 
 
 		 297 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.88 
 
 		 331 aa  96.3  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  38.26 
 
 		 336 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  37.09 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.99 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 322 aa  93.6  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.88 
 
 		 317 aa  93.2  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.13 
 
 		 328 aa  92.4  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.99 
 
 		 331 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.99 
 
 		 331 aa  92  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.53 
 
 		 332 aa  92  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.53 
 
 		 332 aa  91.7  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.3 
 
 		 331 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.3 
 
 		 331 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.99 
 
 		 331 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.62 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.99 
 
 		 331 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.99 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>