More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2072 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  35.04 
 
 
3090 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2243 aa  4376    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  34.09 
 
 
3108 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  33.14 
 
 
1653 aa  658    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  35.52 
 
 
3089 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  36.15 
 
 
1520 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  90.07 
 
 
2226 aa  3932    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  36.26 
 
 
1911 aa  690    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  35.38 
 
 
3093 aa  653    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  35.23 
 
 
4646 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  34.82 
 
 
4647 aa  628  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  34.36 
 
 
1582 aa  626  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  35.57 
 
 
1486 aa  615  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  34.98 
 
 
1466 aa  613  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  30.21 
 
 
2316 aa  610  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  37.55 
 
 
1795 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  32.51 
 
 
1416 aa  605  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  39.29 
 
 
1424 aa  601  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  40.74 
 
 
1302 aa  600  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  32.32 
 
 
3130 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  38.55 
 
 
1909 aa  593  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  35.06 
 
 
2093 aa  585  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  28.36 
 
 
1612 aa  578  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  44.07 
 
 
2498 aa  575  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  38.27 
 
 
2176 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  38.53 
 
 
1574 aa  569  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  36.35 
 
 
1408 aa  569  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 
1646 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  35.55 
 
 
1497 aa  556  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  40.38 
 
 
1470 aa  557  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  40.76 
 
 
2604 aa  545  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  40.54 
 
 
2684 aa  546  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  38.94 
 
 
2679 aa  546  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  41.22 
 
 
1535 aa  546  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  42.03 
 
 
2454 aa  543  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  40.15 
 
 
1489 aa  539  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  39.67 
 
 
1488 aa  536  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 
2150 aa  530  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  40.45 
 
 
3335 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  39.19 
 
 
2682 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
974 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  38.64 
 
 
4186 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  39.6 
 
 
3163 aa  520  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  35.1 
 
 
995 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  36.84 
 
 
2273 aa  516  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  35.1 
 
 
995 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  34.23 
 
 
1612 aa  515  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.33 
 
 
2762 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 
1472 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  36.95 
 
 
2710 aa  513  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.8 
 
 
1656 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  35.41 
 
 
1833 aa  509  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  38.67 
 
 
1472 aa  510  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  38.67 
 
 
1472 aa  510  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  37.09 
 
 
3194 aa  507  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  40.19 
 
 
1560 aa  503  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.47 
 
 
1587 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.36 
 
 
4239 aa  500  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  40.29 
 
 
4265 aa  499  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  40.36 
 
 
4265 aa  500  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  34.76 
 
 
2880 aa  495  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 
3275 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.44 
 
 
6889 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.02 
 
 
3133 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  32.3 
 
 
1465 aa  482  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.02 
 
 
3127 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  31.06 
 
 
3693 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  31.06 
 
 
3693 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  31.12 
 
 
3702 aa  480  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
2551 aa  477  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 
1874 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  27.87 
 
 
1559 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 
1466 aa  474  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.48 
 
 
1087 aa  470  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  32.68 
 
 
1354 aa  468  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  27.73 
 
 
1559 aa  471  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  37.47 
 
 
3337 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.72 
 
 
1337 aa  463  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  36.47 
 
 
1524 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  35.54 
 
 
3099 aa  459  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.46 
 
 
1939 aa  459  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  32.13 
 
 
2551 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
3092 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.01 
 
 
4478 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  38.08 
 
 
3427 aa  453  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  33.97 
 
 
1577 aa  453  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
7110 aa  449  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  35.32 
 
 
1144 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.17 
 
 
3676 aa  450  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  33.77 
 
 
2462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  31.87 
 
 
1581 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  36.98 
 
 
1528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  36.79 
 
 
1530 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
2232 aa  445  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  25.46 
 
 
3099 aa  445  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  38.52 
 
 
4151 aa  447  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  36.9 
 
 
1530 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  32.32 
 
 
4165 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.73 
 
 
3176 aa  444  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  36.16 
 
 
1402 aa  436  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>