71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0853 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  100 
 
 
361 aa  695    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  89.47 
 
 
361 aa  595  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  54.67 
 
 
348 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  55.21 
 
 
343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  52.74 
 
 
329 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  54.46 
 
 
376 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  54.81 
 
 
324 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  55.37 
 
 
340 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  47.56 
 
 
351 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  46.77 
 
 
347 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  45.45 
 
 
305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.48 
 
 
318 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  43.48 
 
 
318 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  49.59 
 
 
298 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  43.12 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  45.27 
 
 
320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  46.31 
 
 
320 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  46.25 
 
 
305 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  43.55 
 
 
314 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  44.72 
 
 
348 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  43.4 
 
 
368 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  50.79 
 
 
270 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  50.79 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  42.78 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.59 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  36.61 
 
 
244 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.22 
 
 
244 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.61 
 
 
244 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  36.22 
 
 
244 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  36.61 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  36.61 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  29.44 
 
 
244 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28.92 
 
 
219 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  36.46 
 
 
207 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  35.6 
 
 
235 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.49 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  37.07 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  35.6 
 
 
235 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  34.76 
 
 
235 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  35.55 
 
 
249 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  32.18 
 
 
296 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.32 
 
 
238 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  25.68 
 
 
246 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  36 
 
 
240 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  35.14 
 
 
240 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  34.24 
 
 
240 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  33.19 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  32.87 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  33.66 
 
 
270 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  34.09 
 
 
244 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  33.18 
 
 
223 aa  47  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 
273 aa  46.6  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.26 
 
 
264 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.27 
 
 
216 aa  46.2  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  29.77 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  31.87 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  26.81 
 
 
213 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.62 
 
 
270 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  24.5 
 
 
223 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.91 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  32.02 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  32.58 
 
 
259 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  29.13 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  23.27 
 
 
206 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  29.68 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  27.89 
 
 
281 aa  43.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
264 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  26.96 
 
 
263 aa  43.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1718  lipolytic protein G-D-S-L family  28.82 
 
 
270 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  20.62 
 
 
211 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  33.02 
 
 
204 aa  42.7  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>