More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2683 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  100 
 
 
475 aa  955    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  69.48 
 
 
767 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  67.97 
 
 
745 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  66.67 
 
 
767 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  63.15 
 
 
479 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  61.49 
 
 
476 aa  515  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  47.33 
 
 
546 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  48.06 
 
 
548 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  47.21 
 
 
467 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  43.71 
 
 
546 aa  385  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  45.25 
 
 
503 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  43.5 
 
 
546 aa  381  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  45.91 
 
 
546 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  46.93 
 
 
561 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  47.16 
 
 
561 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  47.28 
 
 
562 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  46.72 
 
 
561 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  46.53 
 
 
561 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  46.72 
 
 
561 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  46.72 
 
 
561 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  46.93 
 
 
562 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  45.45 
 
 
550 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  46.72 
 
 
561 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  47.36 
 
 
561 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  46.72 
 
 
561 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  46.14 
 
 
547 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  46.78 
 
 
560 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  46.14 
 
 
547 aa  363  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  46.57 
 
 
561 aa  362  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  45.71 
 
 
468 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  46.92 
 
 
564 aa  359  7e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  46.92 
 
 
564 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  46.92 
 
 
565 aa  359  8e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  44.87 
 
 
479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  46.51 
 
 
561 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  45.22 
 
 
468 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  43.47 
 
 
551 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  45.86 
 
 
481 aa  349  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  47.76 
 
 
557 aa  349  7e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  46.21 
 
 
541 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  47.13 
 
 
478 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  45.01 
 
 
562 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  41.76 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  42.28 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  44.21 
 
 
477 aa  335  7.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  41.03 
 
 
550 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  44.16 
 
 
476 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  42.19 
 
 
482 aa  326  7e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  42.26 
 
 
476 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  42.26 
 
 
476 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  42.26 
 
 
476 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  41.33 
 
 
552 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  42.67 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.71 
 
 
469 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  40.3 
 
 
468 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  40.52 
 
 
468 aa  312  9e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  43.54 
 
 
474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  43.54 
 
 
474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  40.34 
 
 
469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  41.38 
 
 
467 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  38.2 
 
 
468 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  42.49 
 
 
458 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  38.66 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.54 
 
 
459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  37.87 
 
 
720 aa  273  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  35.79 
 
 
484 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  37.53 
 
 
453 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  35.76 
 
 
484 aa  267  4e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  35.2 
 
 
485 aa  263  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
585 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.57 
 
 
471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  34.5 
 
 
449 aa  259  7e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.37 
 
 
482 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.7 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  35.82 
 
 
704 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  35.62 
 
 
458 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  34.38 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1205  mercuric reductase  39.34 
 
 
464 aa  252  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295648  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  35.56 
 
 
459 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  35.76 
 
 
464 aa  251  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  35.16 
 
 
510 aa  250  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  32.51 
 
 
460 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  35.59 
 
 
508 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  35.51 
 
 
455 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.11 
 
 
495 aa  246  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  33.84 
 
 
507 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  34.43 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  38.26 
 
 
525 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.14 
 
 
462 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  32.82 
 
 
460 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  34 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.73 
 
 
712 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.48 
 
 
472 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  33.03 
 
 
464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  34.87 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  34.65 
 
 
459 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  34.87 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  34.43 
 
 
458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  33.03 
 
 
464 aa  243  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  33.84 
 
 
461 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>