More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1309 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  100 
 
 		 372 aa  747    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  48.5 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  42.42 
 
 		 435 aa  265  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  41.88 
 
 		 441 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  44.72 
 
 		 421 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  40.98 
 
 		 433 aa  257  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  44.6 
 
 		 420 aa  257  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  41.76 
 
 		 429 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  46.18 
 
 		 509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  43.84 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  41.48 
 
 		 553 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  41.21 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  43.73 
 
 		 406 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  47.24 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  40.22 
 
 		 401 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  43.67 
 
 		 412 aa  250  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  40.55 
 
 		 429 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  42.78 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.5 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  39.95 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.22 
 
 		 419 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  42.78 
 
 		 464 aa  248  9e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  43.73 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  39.94 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  39.67 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  39.67 
 
 		 419 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  44.83 
 
 		 425 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  41.33 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  44.51 
 
 		 424 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  39.67 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  39.67 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  44.51 
 
 		 354 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  44.51 
 
 		 425 aa  245  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  44.51 
 
 		 425 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  44.51 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  44.2 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  42.42 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  39.39 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  40.29 
 
 		 435 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  39.32 
 
 		 535 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  41.46 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  42.65 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  42.5 
 
 		 532 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  39.01 
 
 		 454 aa  242  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  39.38 
 
 		 583 aa  241  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  39.39 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3465  GTP-binding protein  43.89 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  44.2 
 
 		 420 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  39.39 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  39.27 
 
 		 564 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  42.78 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  39.27 
 
 		 564 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  40.66 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  38.46 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  38.36 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  38.02 
 
 		 528 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  40.11 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.29 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  40.57 
 
 		 429 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  47.25 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  40.11 
 
 		 426 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  40.62 
 
 		 431 aa  236  6e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2862  GTP-binding proten HflX  39.14 
 
 		 412 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  39.84 
 
 		 426 aa  235  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  39.84 
 
 		 426 aa  235  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  39.84 
 
 		 426 aa  235  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  39.84 
 
 		 426 aa  235  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  37.5 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  39.84 
 
 		 426 aa  235  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  39.84 
 
 		 426 aa  235  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  39.84 
 
 		 426 aa  235  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  39.28 
 
 		 437 aa  235  8e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  40.97 
 
 		 432 aa  235  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  39.71 
 
 		 435 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  40.98 
 
 		 435 aa  235  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  41.77 
 
 		 431 aa  235  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  39.94 
 
 		 574 aa  235  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  41.88 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.98 
 
 		 395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  40 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1212  GTP-binding proten HflX  43.75 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  40.79 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  39.56 
 
 		 582 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  40.45 
 
 		 428 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  40.45 
 
 		 428 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  40.68 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  37.15 
 
 		 509 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  40.27 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  39.3 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  40.88 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  39.3 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  39.3 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  39.3 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  39.04 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  39.13 
 
 		 409 aa  232  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  38.81 
 
 		 426 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  39.3 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  41.82 
 
 		 396 aa  232  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  41 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  38.83 
 
 		 493 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>