More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1318 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  100 
 
 		 461 aa  920    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  40.38 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  41.33 
 
 		 476 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  40.95 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  40.95 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  41.38 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  41.38 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  38.36 
 
 		 471 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  39.74 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  37.8 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  39.7 
 
 		 467 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  39.7 
 
 		 467 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  38.58 
 
 		 471 aa  328  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  39.48 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  38.36 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  39.7 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  38.15 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  38.15 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  38.15 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  38.15 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  38.15 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  39.26 
 
 		 467 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  39.78 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  39.48 
 
 		 467 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 467 aa  326  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  39.26 
 
 		 467 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  38.03 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  39.35 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  39.7 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  37.8 
 
 		 471 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  37.74 
 
 		 476 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  38.01 
 
 		 468 aa  318  9e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  36.91 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  36.56 
 
 		 471 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  36.56 
 
 		 471 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  36.56 
 
 		 471 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  37.23 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  38.44 
 
 		 467 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  36.56 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  36.56 
 
 		 471 aa  310  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  36.56 
 
 		 471 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  36.13 
 
 		 471 aa  309  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  34.5 
 
 		 489 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  36.34 
 
 		 471 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  38.25 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  35.57 
 
 		 456 aa  306  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  38.17 
 
 		 468 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  38.17 
 
 		 468 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  38.17 
 
 		 468 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  39.96 
 
 		 460 aa  306  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  37.18 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  38.38 
 
 		 466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  37.95 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  38.38 
 
 		 466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  37.61 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  38.59 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  37.1 
 
 		 469 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  37.85 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 465 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  37.87 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  35.78 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  35.11 
 
 		 494 aa  286  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  34.43 
 
 		 495 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  36.89 
 
 		 467 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  36.67 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  36.67 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  36.67 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  35.94 
 
 		 464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  38.3 
 
 		 463 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  36.46 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  36.46 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  36.46 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  36.46 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  36.67 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  36.29 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 495 aa  280  6e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  36.63 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  34.13 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  33.98 
 
 		 483 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  34.82 
 
 		 486 aa  276  5e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  34.13 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  35.11 
 
 		 518 aa  276  8e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  38.63 
 
 		 469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  35.68 
 
 		 463 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  37.31 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  33.76 
 
 		 496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  38.41 
 
 		 465 aa  273  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  36.7 
 
 		 495 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  34.02 
 
 		 495 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  34.26 
 
 		 476 aa  269  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  33.05 
 
 		 506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  32.85 
 
 		 503 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  34.09 
 
 		 492 aa  266  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  32.86 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  33.87 
 
 		 516 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  34.51 
 
 		 482 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 		 500 aa  263  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>