More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1208 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  90.93 
 
 
430 aa  763  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  90.93 
 
 
430 aa  763  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  100 
 
 
430 aa  869  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  4.54316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  65.58 
 
 
428 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  64.88 
 
 
432 aa  540  1e-152  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  65.35 
 
 
428 aa  537  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  63.95 
 
 
428 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  64.65 
 
 
428 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  64.65 
 
 
427 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  63.49 
 
 
428 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  63.72 
 
 
428 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  63.72 
 
 
428 aa  522  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  63.49 
 
 
428 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  63.95 
 
 
428 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  63.72 
 
 
428 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  64.12 
 
 
428 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  59.04 
 
 
437 aa  489  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  59.04 
 
 
435 aa  480  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.98 
 
 
438 aa  451  1e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.77499e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  53.92 
 
 
439 aa  445  1e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  55.15 
 
 
437 aa  438  1e-122  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.58 
 
 
426 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  54.84 
 
 
436 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  52.33 
 
 
428 aa  417  1e-115  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  52.9 
 
 
427 aa  416  1e-115  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  50.81 
 
 
422 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.68 
 
 
425 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.29 
 
 
426 aa  406  1e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  50.35 
 
 
424 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.95 
 
 
425 aa  401  1e-110  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  53.95 
 
 
419 aa  399  1e-110  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  48.38 
 
 
423 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  52.79 
 
 
424 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  48.62 
 
 
428 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  48.62 
 
 
428 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.05 
 
 
417 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.5 
 
 
429 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.8 
 
 
452 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  48.96 
 
 
423 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.93 
 
 
482 aa  354  2e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.15993e-05  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.86 
 
 
464 aa  351  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.47894e-05  hitchhiker  3.62877e-14 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.83 
 
 
437 aa  348  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.58 
 
 
463 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  53.45 
 
 
346 aa  345  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  50.93 
 
 
425 aa  343  3e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.01 
 
 
426 aa  342  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.58 
 
 
435 aa  337  2e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.58 
 
 
435 aa  337  3e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  48.5 
 
 
439 aa  335  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  53.47 
 
 
338 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.57 
 
 
338 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12232e-08  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.44 
 
 
464 aa  330  4e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  1.09453e-12 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  45.14 
 
 
434 aa  328  1e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.92 
 
 
428 aa  324  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.03 
 
 
439 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.88 
 
 
454 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.35 
 
 
435 aa  323  5e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.39 
 
 
338 aa  322  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.44 
 
 
491 aa  322  1e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.66 
 
 
338 aa  320  2e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  53.17 
 
 
353 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  50.76 
 
 
338 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.9426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  52.27 
 
 
354 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  52.27 
 
 
354 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  52.27 
 
 
354 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  42.82 
 
 
439 aa  314  2e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  50.15 
 
 
338 aa  313  3e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.86 
 
 
458 aa  313  3e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  43.94 
 
 
432 aa  311  1e-83  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.17 
 
 
338 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.76 
 
 
505 aa  310  5e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  43.74 
 
 
450 aa  307  2e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.4 
 
 
434 aa  308  2e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  42.96 
 
 
541 aa  306  4e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  47.25 
 
 
387 aa  305  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  41.94 
 
 
500 aa  305  8e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.02 
 
 
463 aa  305  1e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.66 
 
 
427 aa  305  1e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.1 
 
 
327 aa  303  3e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  43.53 
 
 
516 aa  303  6e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.21 
 
 
336 aa  299  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0532  GTPase ObgE  40.59 
 
 
433 aa  297  2e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  41.47 
 
 
424 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  41.71 
 
 
424 aa  296  5e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  45.91 
 
 
353 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  41.32 
 
 
440 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  47.9 
 
 
338 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  48.13 
 
 
356 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  44.19 
 
 
481 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  41.47 
 
 
424 aa  295  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  48.79 
 
 
329 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  48.79 
 
 
329 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  42.53 
 
 
493 aa  292  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  48.34 
 
 
343 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  41.24 
 
 
519 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.22 
 
 
432 aa  288  9e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  43.59 
 
 
529 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  44.19 
 
 
481 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  41.85 
 
 
454 aa  286  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  43.19 
 
 
457 aa  286  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>