More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0166 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 457 aa  944    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  92.29 
 
 		 454 aa  878    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  92.29 
 
 		 454 aa  878    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  64.69 
 
 		 458 aa  608  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  64.41 
 
 		 458 aa  609  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  64.63 
 
 		 458 aa  608  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  64.41 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  64.41 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  64.41 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  64.41 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  64.25 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  64.63 
 
 		 458 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  64.41 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  64.41 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  65.65 
 
 		 457 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  63.16 
 
 		 484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 454 aa  545  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  58.33 
 
 		 457 aa  545  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  58.19 
 
 		 453 aa  535  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  55.29 
 
 		 459 aa  525  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  55.7 
 
 		 470 aa  525  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  56.46 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  54.41 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  61.31 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  61.77 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  55.7 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  55.3 
 
 		 450 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  54.44 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  54.55 
 
 		 453 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  54.2 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  52.86 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  53.32 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  53.78 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  52.41 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  53.85 
 
 		 449 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  51.19 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  48.1 
 
 		 520 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  52.13 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  51 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  51.33 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  50.67 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  48.08 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  49.34 
 
 		 457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  46.02 
 
 		 514 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  46.02 
 
 		 514 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  47.58 
 
 		 458 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  50.55 
 
 		 457 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  49.44 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  48.8 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  50.67 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 458 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  46.86 
 
 		 518 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  49.3 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  47.72 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  48.93 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 456 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  51.29 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 		 456 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  51.29 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 462 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  48.55 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  48.89 
 
 		 477 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  47.42 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  47.54 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  49.34 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  49.34 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  48.11 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  45.81 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  49.34 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  49.22 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  49.34 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>