More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1253 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  100 
 
 		 164 aa  339  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.08 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.08 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.62 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  35.26 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.29 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  40.14 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  39.29 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.3 
 
 		 160 aa  101  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  32.03 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  37.33 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  34.72 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.59 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.87 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  40.65 
 
 		 170 aa  94.4  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  32.14 
 
 		 160 aa  94.4  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 227 aa  94  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  33.59 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  30.92 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.78 
 
 		 575 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.78 
 
 		 575 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 575 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  32.85 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  32.85 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  32.14 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  32.85 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  31.13 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  32.62 
 
 		 570 aa  88.2  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  36.5 
 
 		 574 aa  87.8  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  33.88 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  33.88 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.19 
 
 		 197 aa  84  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  35.92 
 
 		 216 aa  84  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.22 
 
 		 174 aa  84  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 574 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.61 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.58 
 
 		 582 aa  82  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 		 573 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  34.06 
 
 		 575 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.59 
 
 		 576 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  32.14 
 
 		 638 aa  81.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.59 
 
 		 576 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.88 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 		 573 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  35.61 
 
 		 571 aa  80.9  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  33.33 
 
 		 597 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  31.82 
 
 		 572 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.9 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.6 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  31.06 
 
 		 579 aa  78.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  29.71 
 
 		 584 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 		 573 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  34.51 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  32.62 
 
 		 598 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34.01 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  26.57 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.16 
 
 		 574 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.38 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 		 585 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  30.3 
 
 		 576 aa  75.1  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.29 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  34.19 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  33.1 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  29.33 
 
 		 600 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.65 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.45 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1124  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.37 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.373521  hitchhiker  0.0000000875399 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  30 
 
 		 593 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  32.2 
 
 		 613 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  28.95 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  30.43 
 
 		 601 aa  71.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.96 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  29.66 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  35.94 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.2 
 
 		 575 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  30.4 
 
 		 600 aa  71.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 393 aa  70.9  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  28.67 
 
 		 600 aa  70.5  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  25.83 
 
 		 616 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  30.43 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  25.83 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  32.85 
 
 		 591 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.6 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  31.65 
 
 		 582 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  30.71 
 
 		 589 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  32.87 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.05 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>