More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1375 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  100 
 
 		 616 aa  1271    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  58.74 
 
 		 598 aa  770    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  57.88 
 
 		 597 aa  758    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  53.91 
 
 		 593 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  53.76 
 
 		 600 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  99 
 
 		 500 aa  1024    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  62.23 
 
 		 613 aa  800    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  58.57 
 
 		 615 aa  787    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  53.64 
 
 		 600 aa  670    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  51.68 
 
 		 600 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  43.97 
 
 		 570 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  43.59 
 
 		 574 aa  514  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.44 
 
 		 573 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.28 
 
 		 573 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  42.26 
 
 		 584 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.08 
 
 		 573 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  41.11 
 
 		 597 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.52 
 
 		 601 aa  491  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  42.69 
 
 		 569 aa  491  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.91 
 
 		 585 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  40.97 
 
 		 576 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  38.08 
 
 		 575 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 		 571 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  37.34 
 
 		 571 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  37.27 
 
 		 588 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.01 
 
 		 575 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.3 
 
 		 575 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.3 
 
 		 575 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  32.09 
 
 		 571 aa  336  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.65 
 
 		 574 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.78 
 
 		 575 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  30.79 
 
 		 576 aa  319  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  31.3 
 
 		 582 aa  319  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  32.33 
 
 		 575 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.13 
 
 		 572 aa  317  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  31.99 
 
 		 589 aa  314  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28461  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 		 591 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.751796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  30.91 
 
 		 574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 591 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.81 
 
 		 576 aa  306  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  31.05 
 
 		 582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.64 
 
 		 576 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  31.58 
 
 		 592 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  30.83 
 
 		 591 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  30.83 
 
 		 591 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  30.68 
 
 		 591 aa  300  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  30.9 
 
 		 579 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00441  flavoprotein  30.17 
 
 		 591 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  30.24 
 
 		 582 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  30.65 
 
 		 638 aa  277  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 397 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  25.12 
 
 		 508 aa  146  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  27.62 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  26.24 
 
 		 399 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  27.38 
 
 		 878 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  26.72 
 
 		 884 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  26 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 395 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.95 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.15 
 
 		 423 aa  130  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  24.13 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 395 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 		 407 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 		 407 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.32 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  25.06 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  24.69 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.06 
 
 		 392 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.75 
 
 		 397 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  23.52 
 
 		 479 aa  127  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.52 
 
 		 479 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  24.13 
 
 		 402 aa  126  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.29 
 
 		 479 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  23.62 
 
 		 396 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  29.34 
 
 		 431 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 395 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  23.29 
 
 		 479 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.29 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  24.48 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.29 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.92 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.29 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  23.13 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 		 392 aa  124  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  24.5 
 
 		 397 aa  124  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  25.6 
 
 		 405 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.06 
 
 		 479 aa  123  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  25.86 
 
 		 409 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.75 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  24.39 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.31 
 
 		 500 aa  122  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.1 
 
 		 482 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  22.38 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 421 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  23.19 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.79 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.63 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>