More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2183 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  51.01 
 
 
600 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  72.61 
 
 
615 aa  897    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  59.07 
 
 
616 aa  776    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2183  putative flavoprotein  100 
 
 
598 aa  1212    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  84.78 
 
 
597 aa  1018    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  51.35 
 
 
593 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  63.1 
 
 
500 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  64.3 
 
 
613 aa  849    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  51.25 
 
 
600 aa  652    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  52.97 
 
 
600 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  48.64 
 
 
584 aa  571  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  45.1 
 
 
570 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.73 
 
 
573 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.39 
 
 
573 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.32 
 
 
573 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  44.35 
 
 
569 aa  518  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  42.76 
 
 
574 aa  515  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  42.91 
 
 
601 aa  508  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  42.57 
 
 
597 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.42 
 
 
585 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  41.12 
 
 
576 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  40.54 
 
 
575 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 
571 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  39.97 
 
 
571 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  39.49 
 
 
588 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.57 
 
 
575 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.57 
 
 
575 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.57 
 
 
575 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.84 
 
 
574 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  33.39 
 
 
571 aa  343  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  32.21 
 
 
576 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.72 
 
 
576 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.38 
 
 
576 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  34.04 
 
 
582 aa  334  3e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  32.32 
 
 
575 aa  333  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28461  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
591 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.751796 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00571  flavoprotein  33.22 
 
 
592 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  33.55 
 
 
582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  32.1 
 
 
574 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  34.47 
 
 
589 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  31.38 
 
 
582 aa  327  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.66 
 
 
575 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  31.04 
 
 
572 aa  315  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  32.71 
 
 
638 aa  309  9e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  30.64 
 
 
579 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  30.91 
 
 
591 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00461  flavoprotein  30.68 
 
 
591 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.551818  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  30.51 
 
 
591 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00441  flavoprotein  30.85 
 
 
591 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
397 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  25.24 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  25.53 
 
 
878 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  25.24 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  25.53 
 
 
878 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  23.92 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  23.04 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 
396 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.75 
 
 
423 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  22.6 
 
 
425 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  23.57 
 
 
407 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  26.34 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  23.02 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  23.27 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  24.27 
 
 
884 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  22.01 
 
 
407 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 
395 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  22.3 
 
 
407 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 
395 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  26.52 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  22.91 
 
 
407 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  22.11 
 
 
392 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  23.58 
 
 
417 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
421 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  22.08 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.27 
 
 
498 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  21.43 
 
 
397 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.12 
 
 
493 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 
396 aa  117  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  22.72 
 
 
387 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  24.76 
 
 
402 aa  116  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
392 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  21.67 
 
 
402 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.65 
 
 
482 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  23.8 
 
 
479 aa  114  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.8 
 
 
479 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.78 
 
 
479 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.78 
 
 
479 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.78 
 
 
479 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.88 
 
 
494 aa  113  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.78 
 
 
479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.54 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.54 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.54 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.54 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.54 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.54 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  23.54 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.43 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>