More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0133 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  52.79 
 
 
828 aa  794    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  52.69 
 
 
767 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  53.88 
 
 
849 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  47.98 
 
 
747 aa  661    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  47.28 
 
 
794 aa  711    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  52.58 
 
 
806 aa  756    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  52.72 
 
 
805 aa  778    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  52.11 
 
 
833 aa  698    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  49.8 
 
 
826 aa  680    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  49.6 
 
 
798 aa  701    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  52.19 
 
 
805 aa  757    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  52.45 
 
 
805 aa  758    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  52.45 
 
 
805 aa  760    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  51.52 
 
 
829 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  47.54 
 
 
782 aa  676    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  52.58 
 
 
831 aa  734    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  53.63 
 
 
805 aa  681    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  52.45 
 
 
805 aa  757    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  57.12 
 
 
821 aa  775    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  49.8 
 
 
954 aa  700    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  50.72 
 
 
836 aa  680    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  42.28 
 
 
836 aa  644    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  53.93 
 
 
753 aa  795    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  53.15 
 
 
752 aa  779    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  54.24 
 
 
834 aa  725    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  51.4 
 
 
767 aa  666    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  46.51 
 
 
748 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  51.93 
 
 
827 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  50.27 
 
 
743 aa  745    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  49.74 
 
 
868 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  50.4 
 
 
724 aa  641    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  52.19 
 
 
805 aa  757    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  47.38 
 
 
742 aa  672    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  51.57 
 
 
747 aa  701    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  52.8 
 
 
885 aa  755    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  53.31 
 
 
781 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  49.48 
 
 
857 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  52.73 
 
 
805 aa  672    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  50.6 
 
 
827 aa  692    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  52.12 
 
 
797 aa  769    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  47.68 
 
 
802 aa  711    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  51.56 
 
 
837 aa  704    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  52.96 
 
 
762 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  56.08 
 
 
838 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  52.61 
 
 
822 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  52.96 
 
 
762 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  44.6 
 
 
760 aa  636    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  52.34 
 
 
839 aa  683    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  48.24 
 
 
942 aa  684    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  46.98 
 
 
740 aa  667    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  50.59 
 
 
841 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  52.2 
 
 
841 aa  682    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  49.6 
 
 
798 aa  701    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
796 aa  712    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  47.94 
 
 
755 aa  647    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  52.72 
 
 
806 aa  762    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  53.31 
 
 
781 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
759 aa  754    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  55.13 
 
 
838 aa  748    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  54.35 
 
 
836 aa  766    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  55.2 
 
 
833 aa  730    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  49.15 
 
 
814 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  52.83 
 
 
762 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  47.68 
 
 
802 aa  711    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  47.29 
 
 
747 aa  654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  100 
 
 
751 aa  1461    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  45.95 
 
 
750 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  51.95 
 
 
846 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  53.06 
 
 
855 aa  703    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  50.72 
 
 
836 aa  680    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  46.3 
 
 
889 aa  694    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
889 aa  690    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  50.39 
 
 
758 aa  727    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  52.84 
 
 
754 aa  673    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  52.96 
 
 
762 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  51.85 
 
 
821 aa  661    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  49.14 
 
 
872 aa  643    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
746 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  51.13 
 
 
799 aa  692    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  59.42 
 
 
836 aa  835    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  52.72 
 
 
806 aa  762    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  52.45 
 
 
805 aa  760    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  56.07 
 
 
814 aa  754    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  49 
 
 
778 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  54.63 
 
 
840 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  50.52 
 
 
759 aa  732    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  53.71 
 
 
786 aa  772    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  52.58 
 
 
828 aa  794    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  46.14 
 
 
762 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  53.06 
 
 
825 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  45.85 
 
 
976 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  53.27 
 
 
1071 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  46.06 
 
 
844 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  50.43 
 
 
809 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  49.67 
 
 
759 aa  675    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  51.45 
 
 
750 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  52.37 
 
 
852 aa  705    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  50.92 
 
 
748 aa  667    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  49.35 
 
 
857 aa  667    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  52.28 
 
 
803 aa  724    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>