More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2780 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  98.82 
 
 
425 aa  860  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
425 aa  869  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  51.31 
 
 
440 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  49.4 
 
 
440 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  41.87 
 
 
428 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
414 aa  299  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
418 aa  275  1e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  38.29 
 
 
419 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
413 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  36.08 
 
 
413 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
441 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
447 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  26.1 
 
 
778 aa  132  9e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
452 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
782 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
426 aa  116  8e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
409 aa  114  4e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  28.96 
 
 
401 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
426 aa  113  7e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
539 aa  111  2e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
405 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
390 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
414 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
452 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
445 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
391 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
733 aa  106  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
415 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
393 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
415 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  27.64 
 
 
401 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.2 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
462 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
436 aa  97.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
403 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
466 aa  93.2  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
445 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.48 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  28.35 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
403 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
392 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
403 aa  86.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.06 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
423 aa  84  5e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  27.55 
 
 
384 aa  83.2  7e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
401 aa  83.2  9e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
445 aa  83.2  9e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
424 aa  82  2e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
398 aa  80.5  5e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
394 aa  79.7  1e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
404 aa  79.3  1e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
397 aa  78.6  2e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
418 aa  77.8  3e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
420 aa  77.4  4e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
398 aa  76.6  8e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  29.63 
 
 
364 aa  75.9  1e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
1265 aa  75.1  2e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
414 aa  74.3  4e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
453 aa  73.6  6e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
404 aa  73.2  8e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
446 aa  73.2  9e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  1.95577e-05 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
1271 aa  73.2  9e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 
353 aa  72.4  1e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
435 aa  72.8  1e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.72843e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
424 aa  72.8  1e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
406 aa  71.6  2e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  23.97 
 
 
406 aa  70.9  5e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
422 aa  70.9  5e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
924 aa  70.1  8e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
401 aa  69.7  9e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
424 aa  69.7  9e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
1239 aa  68.9  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
415 aa  69.3  1e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 
387 aa  68.9  1e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  31.21 
 
 
416 aa  69.3  1e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
419 aa  68.6  2e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
396 aa  68.9  2e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
414 aa  68.6  2e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 
387 aa  68.6  2e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
405 aa  68.9  2e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  32.45 
 
 
383 aa  68.2  2e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
417 aa  67.8  3e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
753 aa  67.8  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  28.37 
 
 
397 aa  67.8  4e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
423 aa  67.4  4e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
404 aa  67.8  4e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
360 aa  67.8  4e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
400 aa  67  5e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
414 aa  67.4  5e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
1303 aa  67.4  5e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  8.53282e-05 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
436 aa  67.4  5e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.04 
 
 
413 aa  67  6e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  33.73 
 
 
358 aa  66.6  7e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
402 aa  66.6  8e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
397 aa  66.2  9e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>