More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2951 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  53.57 
 
 		 1125 aa  1037    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  89.24 
 
 		 1106 aa  1816    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  90.42 
 
 		 1106 aa  1859    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  100 
 
 		 1119 aa  2191    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  51.43 
 
 		 1120 aa  986    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  39.78 
 
 		 1156 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  59 
 
 		 1121 aa  1163    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  53.05 
 
 		 1124 aa  974    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  39.12 
 
 		 1156 aa  595  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  38.49 
 
 		 1180 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  38.49 
 
 		 1180 aa  586  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  38.01 
 
 		 1159 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  37.96 
 
 		 1161 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  37.97 
 
 		 1157 aa  581  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  38.25 
 
 		 1161 aa  566  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  37.93 
 
 		 1180 aa  562  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  37.14 
 
 		 1162 aa  558  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  37.46 
 
 		 1164 aa  549  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  38.19 
 
 		 1187 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  37.86 
 
 		 1185 aa  531  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  36.03 
 
 		 1164 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  32.31 
 
 		 1155 aa  532  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  35.54 
 
 		 1202 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.2 
 
 		 1183 aa  523  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  36.32 
 
 		 1183 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  36.49 
 
 		 1183 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  39.42 
 
 		 1167 aa  515  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  36.55 
 
 		 1189 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  36.59 
 
 		 1177 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  36.77 
 
 		 1166 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  35.86 
 
 		 1151 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  37.03 
 
 		 1147 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  36.53 
 
 		 1161 aa  486  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  38.58 
 
 		 1157 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  38.49 
 
 		 1182 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  38.22 
 
 		 1165 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  36.54 
 
 		 1147 aa  465  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  36.6 
 
 		 1147 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  30.3 
 
 		 1089 aa  456  1e-127  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  37.83 
 
 		 1157 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  42.16 
 
 		 1157 aa  422  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  29.66 
 
 		 854 aa  392  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.48 
 
 		 860 aa  388  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  40.28 
 
 		 1142 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  34.48 
 
 		 1147 aa  275  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 		 1173 aa  234  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1177 aa  231  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 1173 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.7 
 
 		 1197 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.37 
 
 		 907 aa  197  8.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  28.22 
 
 		 1168 aa  197  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1061 aa  175  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  28.97 
 
 		 1140 aa  173  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 1101 aa  168  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.4 
 
 		 1089 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 		 1087 aa  167  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 1117 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 1110 aa  163  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 		 1101 aa  161  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  27.72 
 
 		 1187 aa  159  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  25.81 
 
 		 1241 aa  159  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.86 
 
 		 1241 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 1115 aa  158  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.29 
 
 		 1139 aa  157  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.51 
 
 		 1241 aa  157  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.86 
 
 		 1241 aa  157  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.38 
 
 		 1240 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.35 
 
 		 1241 aa  156  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.3 
 
 		 1241 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.24 
 
 		 1241 aa  155  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  30.68 
 
 		 1080 aa  155  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  25.3 
 
 		 1241 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  25.3 
 
 		 1241 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  25.98 
 
 		 1242 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 1185 aa  145  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  23.31 
 
 		 1074 aa  144  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 1173 aa  144  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  23.05 
 
 		 1248 aa  141  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  23.73 
 
 		 1218 aa  139  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.18 
 
 		 1207 aa  139  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.51 
 
 		 1236 aa  140  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.56 
 
 		 1186 aa  139  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  26.62 
 
 		 915 aa  135  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 		 1161 aa  133  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1057 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  26.77 
 
 		 1226 aa  131  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.67 
 
 		 1217 aa  131  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.67 
 
 		 1217 aa  131  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  23.74 
 
 		 1110 aa  129  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 		 1103 aa  129  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 		 1121 aa  128  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  24.87 
 
 		 921 aa  127  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.3 
 
 		 1203 aa  127  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  23.63 
 
 		 1110 aa  125  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  29.8 
 
 		 1107 aa  125  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  26.9 
 
 		 1054 aa  125  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.71 
 
 		 1203 aa  125  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.69 
 
 		 1230 aa  125  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.7 
 
 		 1226 aa  124  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 1165 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>