235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1860 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  88.26 
 
 		 247 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  87.85 
 
 		 247 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  53.88 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  53.42 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  47.37 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  38.02 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  39.75 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  39.38 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  39.06 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  33.33 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  33.33 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  37.08 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  37.9 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  36.73 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  39.62 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  35.25 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  35.09 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  39.32 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  39.32 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  36.84 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  36.84 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  36.68 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  32.91 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.97 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  35.34 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  35.8 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  35.59 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  35.59 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  37.26 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  33.47 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  38.18 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  34.13 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  33.06 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  38.12 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  27.14 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  32.91 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 236 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  34.19 
 
 		 197 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  34.48 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.06 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.06 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 		 204 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 		 211 aa  92.4  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  30.82 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  28.05 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  30.77 
 
 		 281 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  24.89 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 		 210 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  27.05 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.95 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  25.76 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  23.41 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  25 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  25.76 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  25.76 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  25.76 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  25.25 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  20.16 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  26.07 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  28.65 
 
 		 671 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 671 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>