145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1356 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 393 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  69.97 
 
 		 392 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  54.55 
 
 		 408 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  44.5 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  44 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  40.72 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  37.66 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  38.44 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  36.34 
 
 		 412 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  34.82 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  32.27 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  32.27 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  31.62 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  32.91 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  32.23 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  32.48 
 
 		 404 aa  166  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  30.93 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  30.34 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  30.57 
 
 		 414 aa  163  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  30.57 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  32.44 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  30.07 
 
 		 413 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  30.07 
 
 		 413 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  29.83 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  29.63 
 
 		 424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  29.91 
 
 		 421 aa  139  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  26.49 
 
 		 544 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  27.7 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  30.28 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  27.25 
 
 		 524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  28.78 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  30.23 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  27.78 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  29.14 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  30.62 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  28.5 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  28.18 
 
 		 416 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  26.79 
 
 		 412 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  25.2 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  25.06 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  28.78 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  26.69 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  30.87 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  26.08 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  24.06 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  27.37 
 
 		 431 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  27.27 
 
 		 444 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  27.18 
 
 		 455 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  27.13 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  27.37 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  25.36 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  30.77 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  25.77 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.68 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  28.41 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  25.63 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  25.78 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  27.37 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  27.78 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  25.26 
 
 		 473 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  31.12 
 
 		 833 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  31.12 
 
 		 833 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  31.12 
 
 		 859 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  28.01 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  25.77 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  25.32 
 
 		 416 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  25.32 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  22.82 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  22.82 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  26.61 
 
 		 434 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  23.68 
 
 		 454 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  23.68 
 
 		 454 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  28.18 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  24 
 
 		 448 aa  93.6  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  27.12 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  25.33 
 
 		 411 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.94 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.57 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  25.4 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  28.89 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  26.44 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  21.61 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  28.64 
 
 		 464 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.86 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  25 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  26.81 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  30 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  23.89 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  27.67 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  30.31 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  27.39 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  26.42 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  29.69 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  26.1 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  23.45 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  26.72 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  20.63 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>