More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3091 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
770 aa  1547    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 
408 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  38.61 
 
 
409 aa  224  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
384 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 
374 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  35.19 
 
 
383 aa  154  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
381 aa  153  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
359 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
374 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
376 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
390 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  56.29 
 
 
378 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  34.18 
 
 
383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  43.33 
 
 
382 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  51.23 
 
 
374 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  38.77 
 
 
370 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 
384 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  35.24 
 
 
388 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  35.03 
 
 
399 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
373 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  30.59 
 
 
382 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  39.4 
 
 
375 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  50.55 
 
 
375 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  50.55 
 
 
375 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
376 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
376 aa  137  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1349  hypothetical protein  32.75 
 
 
336 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
374 aa  134  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3309  hypothetical protein  38.58 
 
 
338 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
377 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  38.15 
 
 
385 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  51.66 
 
 
376 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
386 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
374 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1802  hypothetical protein  31.35 
 
 
346 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
446 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
423 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
373 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  44.3 
 
 
405 aa  126  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 
395 aa  120  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
389 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
376 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1286  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
340 aa  119  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
378 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
355 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
371 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
391 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  39.75 
 
 
425 aa  112  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 
377 aa  111  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  39.71 
 
 
346 aa  111  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  38.43 
 
 
422 aa  111  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  31.65 
 
 
388 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  41.14 
 
 
373 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
395 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
408 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 
482 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  38.71 
 
 
411 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
399 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  37.92 
 
 
420 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
414 aa  108  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
419 aa  108  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
448 aa  108  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
419 aa  108  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
396 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  38.37 
 
 
427 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
380 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  41.28 
 
 
396 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
417 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
413 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  37.87 
 
 
439 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
391 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  43.9 
 
 
395 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
402 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01305  WalW protein  27.27 
 
 
333 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  34.73 
 
 
452 aa  106  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 
415 aa  106  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
427 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
378 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
419 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
450 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  38.91 
 
 
422 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  32.94 
 
 
404 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
439 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
439 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
398 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
389 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
378 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
391 aa  104  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.38 
 
 
428 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.03 
 
 
382 aa  104  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  33.09 
 
 
380 aa  104  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
392 aa  104  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  34.85 
 
 
420 aa  104  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  30.94 
 
 
404 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
442 aa  104  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
377 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>