14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1286 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1286  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 340 aa  689    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1349  hypothetical protein  50 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3309  hypothetical protein  39.13 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1802  hypothetical protein  35.47 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01305  WalW protein  26.15 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 770 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1196  hypothetical protein  26.43 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6503  WalW protein  25.98 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4831  WalW protein  24.52 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.608303  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2250  hypothetical protein  28.67 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.741825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2057  hypothetical protein  30.85 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3081  hypothetical protein  24.52 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1397  hypothetical protein  28.04 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4044  hypothetical protein  28.67 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>