14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1196 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1196  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  701    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01305  WalW protein  48.12 
 
 		 333 aa  328  9e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1349  hypothetical protein  27.73 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3309  hypothetical protein  34.16 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1286  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1802  hypothetical protein  24.21 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3081  hypothetical protein  25.45 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4831  WalW protein  24.46 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.608303  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 		 770 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1397  hypothetical protein  25.76 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.237722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6503  WalW protein  30.39 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2250  hypothetical protein  29.35 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.741825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2057  hypothetical protein  24.79 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0421  hypothetical protein  23.89 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0562711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>