More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2930 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2930  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 352 aa  701    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00193882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2773  histidine kinase  59.94 
 
 		 374 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.76 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5743  histidine kinase  53.54 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.022107  hitchhiker  0.000697261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6826  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.3 
 
 		 379 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4369  histidine kinase  52.74 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5050  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05453  transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  55.3 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 361 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3051  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.87 
 
 		 361 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 367 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.813908  normal  0.38268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2736  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.14 
 
 		 368 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 360 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3781  hypothetical protein  41.53 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  37.97 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 493 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.59 
 
 		 512 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  36.11 
 
 		 463 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  35.84 
 
 		 518 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 518 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  33.75 
 
 		 593 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  33.67 
 
 		 482 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.32 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  33.77 
 
 		 392 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.32 
 
 		 461 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.32 
 
 		 461 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.98 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.08 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.08 
 
 		 364 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.77 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.65 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  34.01 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.33 
 
 		 453 aa  142  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3132  histidine kinase  32.37 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.752444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  37.07 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  33 
 
 		 480 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3224  histidine kinase  29.91 
 
 		 389 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  33.93 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 464 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.37 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25.87 
 
 		 473 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  38.62 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2693  histidine kinase  30.35 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.751419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 483 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.85 
 
 		 467 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.17 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.74 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.07 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 516 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 451 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3085  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 391 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.389389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 476 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  33.73 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  33.73 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.33 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.73 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.73 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  33.73 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.2 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.2 
 
 		 467 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.2 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 504 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.2 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04835  two-component system sensor protein  34.25 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.81 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.33 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.94 
 
 		 467 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 499 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.97 
 
 		 463 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  30 
 
 		 471 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  36.14 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 471 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  33.45 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 723 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  34.21 
 
 		 465 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>