More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2796 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  100 
 
 
718 aa  1417    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  52.39 
 
 
731 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  49.27 
 
 
712 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  46.39 
 
 
716 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  39.51 
 
 
691 aa  509  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  40.14 
 
 
691 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  40.61 
 
 
701 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  38.01 
 
 
691 aa  487  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  41.46 
 
 
719 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  42.84 
 
 
698 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  34.89 
 
 
696 aa  464  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  37.02 
 
 
693 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
718 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  38.85 
 
 
971 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  41.32 
 
 
752 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0498  heavy metal translocating P-type ATPase  39.16 
 
 
700 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  34.36 
 
 
699 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  34.68 
 
 
710 aa  359  8e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  29.97 
 
 
698 aa  354  2.9999999999999997e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  33.53 
 
 
770 aa  350  6e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  33.72 
 
 
695 aa  346  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  32.85 
 
 
698 aa  345  2e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06700  heavy metal translocating P-type ATPase  35.49 
 
 
702 aa  338  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000434785  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  35.77 
 
 
718 aa  330  8e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
702 aa  329  9e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  33.81 
 
 
703 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  30.13 
 
 
691 aa  325  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.34 
 
 
737 aa  324  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  31.73 
 
 
743 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
747 aa  323  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0966  heavy metal translocating P-type ATPase  33.57 
 
 
722 aa  322  9.999999999999999e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000592542  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  35.76 
 
 
693 aa  317  6e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  30.73 
 
 
805 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  31.41 
 
 
723 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  29.9 
 
 
755 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
734 aa  292  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6437  heavy metal translocating P-type ATPase  30.75 
 
 
817 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  33.39 
 
 
634 aa  279  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  30.27 
 
 
766 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  38.62 
 
 
793 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.33 
 
 
798 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  36.19 
 
 
637 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  33.21 
 
 
819 aa  274  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  30.93 
 
 
851 aa  273  6e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  33.95 
 
 
645 aa  273  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.18 
 
 
797 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  34.19 
 
 
826 aa  272  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0489  heavy metal translocating P-type ATPase  38.21 
 
 
751 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  31.75 
 
 
866 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  30.74 
 
 
796 aa  271  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  39.09 
 
 
857 aa  270  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  33.55 
 
 
623 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  31.41 
 
 
630 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  33.56 
 
 
639 aa  268  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  33.84 
 
 
837 aa  268  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  31.79 
 
 
817 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2844  heavy metal translocating P-type ATPase  31.84 
 
 
872 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
817 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
817 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  32.43 
 
 
828 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  32.06 
 
 
828 aa  264  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  35.78 
 
 
750 aa  264  6e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  29.45 
 
 
833 aa  263  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  32.3 
 
 
828 aa  263  8e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  32.55 
 
 
818 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  32.88 
 
 
707 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0981  cation transport ATPase  28.04 
 
 
633 aa  262  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  35.12 
 
 
804 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  37.86 
 
 
806 aa  260  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  32.54 
 
 
836 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  32.66 
 
 
797 aa  259  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  30.88 
 
 
798 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  34.84 
 
 
827 aa  259  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
835 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  34.86 
 
 
670 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  30.88 
 
 
798 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  32.61 
 
 
838 aa  258  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  30.85 
 
 
894 aa  257  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  34.93 
 
 
823 aa  257  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  33.21 
 
 
833 aa  256  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.53 
 
 
915 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2005  heavy metal translocating P-type ATPase  35.08 
 
 
753 aa  254  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
942 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21740  heavy metal translocating P-type ATPase  34.13 
 
 
631 aa  253  7e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000439315  normal  0.410793 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  34.79 
 
 
639 aa  253  7e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 
827 aa  253  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4952  heavy metal translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
648 aa  253  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.33362  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  36.27 
 
 
628 aa  252  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  33.02 
 
 
840 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1763  heavy metal translocating P-type ATPase  33.94 
 
 
720 aa  253  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
758 aa  253  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  31.39 
 
 
644 aa  252  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  32.51 
 
 
839 aa  252  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  33.06 
 
 
821 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  32.51 
 
 
799 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  29.3 
 
 
616 aa  251  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
748 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0879  heavy metal translocating P-type ATPase  32.82 
 
 
762 aa  251  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.573666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  34.6 
 
 
868 aa  251  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  35.26 
 
 
811 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>