More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2577 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
698 aa  1377    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  61.84 
 
 
701 aa  836    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  59.2 
 
 
719 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  47.51 
 
 
691 aa  626  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  46.98 
 
 
691 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  45.19 
 
 
691 aa  598  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  42.4 
 
 
696 aa  571  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  45.05 
 
 
716 aa  525  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  42.98 
 
 
718 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  41.68 
 
 
712 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 
731 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  44.73 
 
 
752 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  37.26 
 
 
693 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 
699 aa  432  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  41.35 
 
 
971 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  37.2 
 
 
718 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  36.43 
 
 
710 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  35.2 
 
 
691 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0966  heavy metal translocating P-type ATPase  36.16 
 
 
722 aa  380  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000592542  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0498  heavy metal translocating P-type ATPase  37.46 
 
 
700 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06700  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
702 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000434785  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  34.57 
 
 
695 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
698 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  33.47 
 
 
718 aa  348  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  29.66 
 
 
698 aa  342  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
693 aa  337  3.9999999999999995e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  31.22 
 
 
702 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32 
 
 
737 aa  318  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  33.62 
 
 
747 aa  318  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  33.29 
 
 
703 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 
734 aa  314  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  30.85 
 
 
723 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  31.3 
 
 
755 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  30.47 
 
 
743 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 
805 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
798 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.01 
 
 
770 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0489  heavy metal translocating P-type ATPase  32.32 
 
 
751 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.09 
 
 
805 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  36.08 
 
 
670 aa  291  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  37.36 
 
 
628 aa  289  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6437  heavy metal translocating P-type ATPase  31.36 
 
 
817 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30.74 
 
 
797 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  32.53 
 
 
833 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  34.64 
 
 
806 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  33.18 
 
 
699 aa  284  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  34.46 
 
 
806 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  34.46 
 
 
806 aa  283  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  34.7 
 
 
798 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  34.7 
 
 
798 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  32.7 
 
 
787 aa  281  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  34.08 
 
 
805 aa  280  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  37.13 
 
 
761 aa  280  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  34.08 
 
 
805 aa  280  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  34.08 
 
 
805 aa  280  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 
821 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  33.9 
 
 
805 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  31.83 
 
 
644 aa  279  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  31.73 
 
 
645 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  34.62 
 
 
819 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  34.42 
 
 
805 aa  277  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  34.42 
 
 
805 aa  277  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2820  heavy metal translocating P-type ATPase  27.84 
 
 
872 aa  276  8e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.48 
 
 
797 aa  276  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  33.22 
 
 
820 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  34.32 
 
 
755 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  33.72 
 
 
837 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  32.44 
 
 
815 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  34.34 
 
 
792 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
757 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
851 aa  274  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  30.2 
 
 
812 aa  273  7e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  34.28 
 
 
643 aa  273  9e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  33.72 
 
 
804 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
814 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  34.31 
 
 
645 aa  272  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  36.12 
 
 
789 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  32.42 
 
 
767 aa  272  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  35.86 
 
 
817 aa  272  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  31.6 
 
 
743 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
821 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  34.24 
 
 
750 aa  271  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  30.83 
 
 
620 aa  271  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
773 aa  271  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
818 aa  271  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1839  heavy metal translocating P-type ATPase  33.5 
 
 
625 aa  270  5.9999999999999995e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  31.97 
 
 
630 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  32.2 
 
 
737 aa  270  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
826 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  33.88 
 
 
889 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  34.71 
 
 
827 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 
795 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  33.17 
 
 
743 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  32.22 
 
 
817 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  35.64 
 
 
804 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  32.22 
 
 
817 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  31.62 
 
 
807 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
762 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 
766 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>