More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2844 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1911  heavy metal translocating P-type ATPase  56.57 
 
 
839 aa  850    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6437  heavy metal translocating P-type ATPase  46.05 
 
 
817 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2844  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
872 aa  1769    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2820  heavy metal translocating P-type ATPase  71.69 
 
 
872 aa  1245    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  32.62 
 
 
703 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
770 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  30.64 
 
 
755 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  30.55 
 
 
805 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 
743 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  30.34 
 
 
723 aa  318  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  28.3 
 
 
698 aa  314  3.9999999999999997e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  30.48 
 
 
699 aa  314  4.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
716 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  33.39 
 
 
766 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  29.49 
 
 
693 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  29.73 
 
 
702 aa  298  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  30.5 
 
 
819 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  28.69 
 
 
737 aa  291  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  30.08 
 
 
710 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  30.22 
 
 
698 aa  278  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  28.53 
 
 
691 aa  276  8e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  28.7 
 
 
691 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  30.23 
 
 
701 aa  270  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  29.73 
 
 
695 aa  267  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  28.1 
 
 
719 aa  266  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  27.64 
 
 
691 aa  263  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  31.59 
 
 
718 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  31.7 
 
 
752 aa  262  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  31.91 
 
 
971 aa  261  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  32.01 
 
 
699 aa  257  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  30.02 
 
 
783 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  31.83 
 
 
712 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  30.62 
 
 
635 aa  254  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 
747 aa  252  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0966  heavy metal translocating P-type ATPase  27.35 
 
 
722 aa  252  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000592542  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  28.83 
 
 
691 aa  249  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  28.28 
 
 
718 aa  249  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2001  heavy metal translocating P-type ATPase  29.89 
 
 
829 aa  248  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.790447  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1695  E1-E2 ATPase-associated domain-containing protein  26.81 
 
 
889 aa  247  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  30.87 
 
 
718 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  30.81 
 
 
734 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  28.09 
 
 
696 aa  245  3e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06700  heavy metal translocating P-type ATPase  30.09 
 
 
702 aa  243  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000434785  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  27.3 
 
 
797 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  29.25 
 
 
839 aa  241  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  33.53 
 
 
834 aa  241  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  33.12 
 
 
792 aa  241  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  30.26 
 
 
742 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  29.88 
 
 
644 aa  241  5.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
827 aa  240  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.88 
 
 
814 aa  240  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  33.91 
 
 
787 aa  240  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  30.46 
 
 
818 aa  240  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  30.1 
 
 
758 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  30.55 
 
 
639 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  31.2 
 
 
851 aa  238  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  28.52 
 
 
817 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  27.75 
 
 
698 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  30.68 
 
 
643 aa  238  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  28.52 
 
 
817 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  27.63 
 
 
926 aa  237  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1348  heavy metal translocating P-type ATPase  28.76 
 
 
643 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0452174  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  33.27 
 
 
835 aa  235  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  27.73 
 
 
797 aa  234  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  29.85 
 
 
821 aa  234  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  31.72 
 
 
689 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  30.48 
 
 
693 aa  234  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  27.81 
 
 
731 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  31.58 
 
 
783 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  27.5 
 
 
833 aa  233  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  32.02 
 
 
814 aa  232  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  28.42 
 
 
620 aa  232  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  29.44 
 
 
639 aa  233  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  24.89 
 
 
743 aa  233  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  27.76 
 
 
616 aa  231  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1442  heavy metal translocating P-type ATPase  27.37 
 
 
791 aa  232  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.153784  normal  0.0826398 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  26.42 
 
 
976 aa  232  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  32.55 
 
 
793 aa  231  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  30.39 
 
 
789 aa  231  6e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0498  heavy metal translocating P-type ATPase  32 
 
 
700 aa  230  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  29.91 
 
 
816 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  29.21 
 
 
737 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  31.37 
 
 
833 aa  229  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  29.93 
 
 
651 aa  229  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  31.63 
 
 
838 aa  228  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  29.59 
 
 
640 aa  228  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000621697  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  29.15 
 
 
760 aa  228  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  29.14 
 
 
889 aa  228  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 
804 aa  228  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  31.16 
 
 
751 aa  227  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  32.02 
 
 
1020 aa  227  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  27.13 
 
 
750 aa  227  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  28.4 
 
 
817 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  31.58 
 
 
645 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2203  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  28.5 
 
 
700 aa  226  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.588592 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  32.1 
 
 
818 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  29.96 
 
 
670 aa  226  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  27.42 
 
 
868 aa  226  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  29.34 
 
 
889 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  26.12 
 
 
799 aa  225  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>