More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1911 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1911  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
839 aa  1706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2844  heavy metal translocating P-type ATPase  56.57 
 
 
872 aa  877    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2820  heavy metal translocating P-type ATPase  55.32 
 
 
872 aa  878    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6437  heavy metal translocating P-type ATPase  45.93 
 
 
817 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  32.19 
 
 
743 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 
755 aa  337  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  31.61 
 
 
703 aa  331  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.03 
 
 
770 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  30.83 
 
 
805 aa  320  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  31.01 
 
 
702 aa  318  3e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  34.17 
 
 
699 aa  316  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  33.22 
 
 
693 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  28.3 
 
 
698 aa  306  1.0000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  29.51 
 
 
737 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  29.21 
 
 
723 aa  296  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  36.27 
 
 
752 aa  293  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  31.55 
 
 
710 aa  291  4e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  30.79 
 
 
698 aa  290  8e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
716 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  27.86 
 
 
691 aa  287  5e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  31.9 
 
 
766 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  30.68 
 
 
819 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 
971 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  34.69 
 
 
691 aa  281  4e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  32.34 
 
 
695 aa  280  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  35.28 
 
 
691 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  32.25 
 
 
718 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  29.2 
 
 
718 aa  263  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  28.23 
 
 
696 aa  262  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  28.32 
 
 
797 aa  258  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  34.49 
 
 
693 aa  257  5e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  32.55 
 
 
806 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  30.97 
 
 
783 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  29.94 
 
 
747 aa  256  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  30.65 
 
 
701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2001  heavy metal translocating P-type ATPase  31.81 
 
 
829 aa  255  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.790447  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  32.15 
 
 
691 aa  255  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  33.14 
 
 
787 aa  254  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0514  heavy metal translocating P-type ATPase  33.16 
 
 
633 aa  253  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  32.03 
 
 
806 aa  252  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  30.6 
 
 
718 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  30.2 
 
 
639 aa  251  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06700  heavy metal translocating P-type ATPase  29.72 
 
 
702 aa  251  6e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000434785  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  31.31 
 
 
719 aa  250  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  27.94 
 
 
758 aa  250  8e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  31.39 
 
 
805 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  30.03 
 
 
803 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  33.89 
 
 
715 aa  247  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  31.53 
 
 
806 aa  246  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  31.69 
 
 
792 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  31.9 
 
 
823 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  31.05 
 
 
816 aa  245  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0966  heavy metal translocating P-type ATPase  28.47 
 
 
722 aa  245  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000592542  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  31.53 
 
 
805 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  31.53 
 
 
805 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  31.53 
 
 
805 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  29.07 
 
 
698 aa  244  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  30.1 
 
 
712 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  31.25 
 
 
644 aa  243  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  31.33 
 
 
805 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  28.62 
 
 
724 aa  242  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  31.33 
 
 
805 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  31.33 
 
 
805 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1442  heavy metal translocating P-type ATPase  29.36 
 
 
791 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.153784  normal  0.0826398 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  31.21 
 
 
818 aa  241  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  30.93 
 
 
828 aa  241  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  30.73 
 
 
734 aa  241  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  34.71 
 
 
817 aa  241  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  29.43 
 
 
851 aa  241  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  31.49 
 
 
889 aa  240  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  33.79 
 
 
792 aa  240  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  31.35 
 
 
674 aa  239  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  31.17 
 
 
795 aa  240  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  27.01 
 
 
743 aa  240  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  31 
 
 
821 aa  239  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  29.76 
 
 
620 aa  239  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  30.22 
 
 
817 aa  239  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  26.43 
 
 
723 aa  238  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 
786 aa  238  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  32.92 
 
 
645 aa  238  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.3 
 
 
889 aa  238  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  31.36 
 
 
755 aa  237  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  30.58 
 
 
674 aa  237  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  30.58 
 
 
674 aa  237  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  31.58 
 
 
793 aa  236  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  29.9 
 
 
810 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  26.79 
 
 
976 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  34.24 
 
 
835 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  30.66 
 
 
818 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  31.02 
 
 
794 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  30.55 
 
 
751 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 
895 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  36.02 
 
 
725 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  31.41 
 
 
760 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  28.47 
 
 
839 aa  235  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 
827 aa  235  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  26.74 
 
 
799 aa  235  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  36.02 
 
 
720 aa  235  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  30.52 
 
 
836 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  30.52 
 
 
836 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>