More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0981 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0981  cation transport ATPase  100 
 
 
633 aa  1263    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  50.48 
 
 
634 aa  595  1e-169  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  47.79 
 
 
616 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  46.73 
 
 
620 aa  558  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  42.16 
 
 
639 aa  482  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  42.52 
 
 
679 aa  463  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  38.42 
 
 
639 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  39 
 
 
628 aa  456  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  42.59 
 
 
667 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  42.05 
 
 
643 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  41.73 
 
 
656 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
646 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
833 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.53 
 
 
783 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  36.41 
 
 
769 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1801  heavy metal translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
639 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0762097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  36.24 
 
 
751 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
767 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  34.48 
 
 
712 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
712 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  36.97 
 
 
734 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  35.25 
 
 
752 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  35.67 
 
 
728 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
939 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  34.06 
 
 
712 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
753 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  35.67 
 
 
728 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  36.32 
 
 
678 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  35.1 
 
 
711 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  36.03 
 
 
726 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
734 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  34.98 
 
 
737 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  34.53 
 
 
800 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 
750 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  35.02 
 
 
800 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  35.02 
 
 
800 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  35.22 
 
 
630 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  34.09 
 
 
799 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
750 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
734 aa  362  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.66 
 
 
752 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  33.55 
 
 
748 aa  361  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  35.39 
 
 
750 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  35.61 
 
 
814 aa  359  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  35.75 
 
 
709 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 
750 aa  359  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  35.88 
 
 
726 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  34.81 
 
 
718 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  32.85 
 
 
707 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.26 
 
 
739 aa  356  7.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  34.95 
 
 
844 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
704 aa  355  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  36.06 
 
 
830 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
701 aa  353  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  35.15 
 
 
800 aa  353  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  35.15 
 
 
800 aa  353  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  34.61 
 
 
713 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  36.24 
 
 
828 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  34.36 
 
 
794 aa  351  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
713 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  34.66 
 
 
793 aa  350  5e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  34.66 
 
 
641 aa  350  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  34.66 
 
 
641 aa  350  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  34.66 
 
 
641 aa  350  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
713 aa  349  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  36.3 
 
 
712 aa  349  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  34.93 
 
 
641 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  34.66 
 
 
641 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
832 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
834 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
832 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
834 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  34.45 
 
 
641 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
791 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  33.71 
 
 
803 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  34.5 
 
 
641 aa  346  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 
635 aa  347  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  34.35 
 
 
641 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  33.79 
 
 
984 aa  346  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  33.79 
 
 
984 aa  346  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  34.25 
 
 
799 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  34.66 
 
 
641 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  35.39 
 
 
709 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
673 aa  343  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  33.28 
 
 
800 aa  343  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
799 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.54 
 
 
709 aa  340  4e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  35.24 
 
 
762 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  35.45 
 
 
641 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 
801 aa  339  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  35.1 
 
 
712 aa  339  9e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  34.36 
 
 
744 aa  339  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  34.55 
 
 
641 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  35.47 
 
 
1022 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  36.1 
 
 
757 aa  337  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  34.57 
 
 
955 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  33.55 
 
 
748 aa  336  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  32.75 
 
 
904 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 
812 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  35.1 
 
 
832 aa  335  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>