More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2226 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 468 aa  936    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  43.74 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  41.92 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  41.38 
 
 		 468 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 469 aa  342  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 462 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.913369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 462 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  41.72 
 
 		 472 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  43.26 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  39.43 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  37.39 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  38.88 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  38.41 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 439 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  35.68 
 
 		 439 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 435 aa  246  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 442 aa  243  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  34.02 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 717 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 440 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 440 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  32.88 
 
 		 458 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 488 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 488 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 485 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  40.88 
 
 		 276 aa  183  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 330 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 480 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  38.85 
 
 		 391 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  37.87 
 
 		 499 aa  170  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 443 aa  169  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 535 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  37 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  29.37 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  30.28 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  30.14 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  29.43 
 
 		 432 aa  167  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  28.8 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.74 
 
 		 396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  36.68 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  34.6 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  35.15 
 
 		 440 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  34.26 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  33.33 
 
 		 482 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 484 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  37.68 
 
 		 479 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 442 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>