More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3263 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  93.16 
 
 		 395 aa  708    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 		 395 aa  780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  99.24 
 
 		 395 aa  775    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  80.45 
 
 		 401 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  79.64 
 
 		 407 aa  626  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  73.42 
 
 		 401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  75.86 
 
 		 403 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  74.27 
 
 		 405 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  73.08 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  73.08 
 
 		 408 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  73.08 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  73.08 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  73.08 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  74.8 
 
 		 396 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  74.54 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  74.54 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  72.82 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  74.8 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  74.27 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  71.83 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  72.31 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  74.54 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  71.39 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  70.26 
 
 		 379 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  68.73 
 
 		 381 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  61.06 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  59.02 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  59.02 
 
 		 444 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  60.13 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  60.27 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  60.59 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  67.2 
 
 		 394 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  60.6 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  60.32 
 
 		 442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  54.97 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  55.81 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.46 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.45 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  54.81 
 
 		 390 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  54.2 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  48.49 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  48.49 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  44.69 
 
 		 284 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.86 
 
 		 282 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.06 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.11 
 
 		 282 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  44.49 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  43.01 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.89 
 
 		 282 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  43.38 
 
 		 282 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  42.65 
 
 		 284 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  41.6 
 
 		 278 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  42.65 
 
 		 276 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  41.91 
 
 		 283 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.2 
 
 		 271 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.84 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  48.18 
 
 		 271 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  41.37 
 
 		 271 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  45.54 
 
 		 271 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  45 
 
 		 271 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  41.37 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  39.26 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.38 
 
 		 284 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.24 
 
 		 310 aa  176  9e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.95 
 
 		 283 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  42.2 
 
 		 320 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  38.96 
 
 		 283 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.01 
 
 		 272 aa  159  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  39.68 
 
 		 255 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  37.25 
 
 		 329 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.47 
 
 		 323 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  36.47 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  36.82 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  32.31 
 
 		 325 aa  147  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  34.4 
 
 		 315 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  38 
 
 		 378 aa  146  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.91 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.89 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  32.27 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  38.89 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.89 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  35.11 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  36.86 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.42 
 
 		 346 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.51 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.47 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.63 
 
 		 321 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.9 
 
 		 258 aa  139  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  34.51 
 
 		 304 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  34.98 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.33 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  38.96 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  39.39 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  36.13 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  35.66 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  35.71 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  35.12 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  35.71 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  42.86 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>