More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3577 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  92.01 
 
 		 454 aa  748    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  100 
 
 		 439 aa  874    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.7 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.47 
 
 		 437 aa  487  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  52.91 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.06 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  49.77 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.47 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  53.1 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  47.64 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.35 
 
 		 435 aa  372  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.77 
 
 		 427 aa  362  9e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  51.62 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  49.76 
 
 		 424 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.1 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.29 
 
 		 425 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.17 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  45.52 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  50.12 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  48.5 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  48.25 
 
 		 428 aa  342  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.28 
 
 		 482 aa  342  8e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.7 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  47.55 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  47.55 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  52 
 
 		 424 aa  338  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  47.55 
 
 		 428 aa  338  9e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  47.55 
 
 		 428 aa  338  9e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  47.32 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  54.21 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  48.48 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  52 
 
 		 423 aa  335  7e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  48.14 
 
 		 427 aa  335  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  47.1 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  47.1 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.49 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  45.39 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  46.65 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.21 
 
 		 464 aa  329  7e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  46.07 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.65 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.03 
 
 		 458 aa  325  7e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  46.49 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.45 
 
 		 429 aa  320  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  46.45 
 
 		 435 aa  319  6e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  42.28 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  45.35 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.05 
 
 		 464 aa  317  4e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  55.56 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  55.26 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  45.21 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  55.56 
 
 		 354 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  44.63 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  55.19 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  43.69 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  42.18 
 
 		 500 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  43.93 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.13 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.81 
 
 		 452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  53.29 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  45.75 
 
 		 457 aa  302  8.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  53.31 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.82 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  51.84 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  44.83 
 
 		 493 aa  299  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  54.74 
 
 		 397 aa  299  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  46.58 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  53.89 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.41 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.07 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  45.22 
 
 		 516 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 338 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.13 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.13 
 
 		 505 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  43.26 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  51.52 
 
 		 326 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 338 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.82 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  49.26 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  43.69 
 
 		 519 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.27 
 
 		 463 aa  285  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  52.54 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  46.37 
 
 		 408 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.66 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  46.37 
 
 		 408 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.63 
 
 		 338 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  45.08 
 
 		 481 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  53.33 
 
 		 358 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  46.09 
 
 		 408 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  52.58 
 
 		 370 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  51.18 
 
 		 346 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>