133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3343 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  84.54 
 
 		 414 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  100 
 
 		 414 aa  816    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  69.73 
 
 		 415 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  69.98 
 
 		 415 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  69.49 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  64.89 
 
 		 419 aa  544  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  64.72 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  66.59 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  66.34 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  66.1 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  58.94 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  51.82 
 
 		 408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  51.09 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  48.3 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  51.78 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  51.82 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  51.57 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  51.58 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  51.58 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  51.58 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  47.6 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  51.09 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  51.09 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  51.93 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  51.69 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  51.69 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  45.65 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  50.36 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  49.64 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  49.64 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  50.61 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  47.58 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  47.34 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  46.6 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  48.69 
 
 		 409 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  47.1 
 
 		 409 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  44.34 
 
 		 411 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  47.09 
 
 		 409 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  47.82 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  47.82 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  49.76 
 
 		 409 aa  359  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  47.82 
 
 		 409 aa  353  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  45.89 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  43.09 
 
 		 423 aa  350  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  51.14 
 
 		 409 aa  348  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  48.54 
 
 		 409 aa  342  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  38.67 
 
 		 427 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  39.44 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  39.7 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  37.8 
 
 		 476 aa  266  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  36.48 
 
 		 479 aa  249  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  44.62 
 
 		 200 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  41.46 
 
 		 201 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  41.46 
 
 		 201 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  41.46 
 
 		 194 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  42.27 
 
 		 195 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000554794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  42.16 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1647  nucleoside recognition domain protein  39.6 
 
 		 191 aa  152  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  49.03 
 
 		 177 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  49.03 
 
 		 177 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  47.1 
 
 		 180 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  40.21 
 
 		 210 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000373949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  50.65 
 
 		 177 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  43.37 
 
 		 194 aa  149  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  45.61 
 
 		 201 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  38.74 
 
 		 194 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1198  nucleoside recognition domain-containing protein  47.17 
 
 		 199 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.499507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  45.28 
 
 		 197 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3414  nucleoside recognition domain protein  43.05 
 
 		 179 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2093  nucleoside recognition domain protein  44.38 
 
 		 197 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.752019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1356  nucleoside recognition  42.25 
 
 		 201 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  44.44 
 
 		 177 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  40.99 
 
 		 177 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  49.35 
 
 		 440 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  43.87 
 
 		 173 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3988  nucleoside recognition domain protein  41.24 
 
 		 191 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000391988 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  43.31 
 
 		 178 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0706  nucleoside recognition domain protein  46.05 
 
 		 182 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  43.87 
 
 		 178 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4200  nucleoside recognition domain protein  50 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.670232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3903  nucleoside recognition domain protein  40.41 
 
 		 191 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4076  nucleoside recognition  50 
 
 		 201 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  42.36 
 
 		 193 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0397  nucleoside recognition domain protein  40.74 
 
 		 177 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4225  nucleoside recognition domain protein  55.56 
 
 		 202 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1731  nucleoside recognition domain protein  40.83 
 
 		 181 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  39.15 
 
 		 197 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1394  nucleoside recognition domain-containing protein  37.5 
 
 		 176 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0396  nucleoside recognition domain protein  36.27 
 
 		 198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  43.05 
 
 		 177 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11840  nucleoside recognition domain protein  39.35 
 
 		 176 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.456869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  40.13 
 
 		 176 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1596  spore maturation protein  35.76 
 
 		 176 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1381  spore maturation protein  35.76 
 
 		 176 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.787008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1354  spore maturation protein B  35.76 
 
 		 176 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1353  spore maturation protein B  35.76 
 
 		 176 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.727797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1492  spore maturation protein  35.76 
 
 		 176 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1632  spore maturation protein  36.36 
 
 		 176 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1564  spore maturation protein  35.76 
 
 		 176 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000627549 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2224  nucleoside recognition domain protein  39.24 
 
 		 177 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>