133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0154 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  97.07 
 
 		 409 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  88.97 
 
 		 413 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  88.97 
 
 		 413 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  88.73 
 
 		 409 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  85.09 
 
 		 409 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  96.81 
 
 		 409 aa  760    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  84.84 
 
 		 409 aa  692    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 		 409 aa  800    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  96.58 
 
 		 409 aa  754    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  81.13 
 
 		 409 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  80.39 
 
 		 409 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  79.66 
 
 		 409 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  81.62 
 
 		 409 aa  591  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  61.27 
 
 		 409 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  59.56 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  58.15 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  55.96 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  56.45 
 
 		 408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  56.2 
 
 		 408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  56.45 
 
 		 408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  56.45 
 
 		 408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  54.99 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  56.34 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  54.9 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  56.45 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  56.69 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  56.2 
 
 		 408 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  55.47 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  56.69 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  53.53 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  55.37 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  45.59 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  47.74 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  43.63 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  44.61 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  46.86 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  47.09 
 
 		 414 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  43.33 
 
 		 423 aa  359  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  44.89 
 
 		 415 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  45.71 
 
 		 415 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  47.22 
 
 		 414 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  44.66 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  47.33 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  47.33 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  46.12 
 
 		 417 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  43.38 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  42.63 
 
 		 427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  37.9 
 
 		 479 aa  259  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  39.77 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  37.6 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  35.68 
 
 		 437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  39.85 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  52.9 
 
 		 177 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  52.9 
 
 		 177 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  42.5 
 
 		 200 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  45.26 
 
 		 177 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  41.62 
 
 		 201 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  41.62 
 
 		 201 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  46.58 
 
 		 180 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  44.65 
 
 		 177 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  49.36 
 
 		 173 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  37.37 
 
 		 195 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000554794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  42.47 
 
 		 197 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2224  nucleoside recognition domain protein  46.01 
 
 		 177 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  48.05 
 
 		 178 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  40.61 
 
 		 197 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  46.71 
 
 		 177 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  42.35 
 
 		 193 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  41.88 
 
 		 194 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  44.85 
 
 		 176 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0706  nucleoside recognition domain protein  47.1 
 
 		 182 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  41.42 
 
 		 194 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  40.1 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11840  nucleoside recognition domain protein  41.21 
 
 		 176 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.456869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0397  nucleoside recognition domain protein  45.4 
 
 		 177 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1195  nucleoside recognition domain-containing protein  43.95 
 
 		 176 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  39 
 
 		 194 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  44.23 
 
 		 178 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1394  nucleoside recognition domain-containing protein  43.31 
 
 		 176 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1596  spore maturation protein  43.31 
 
 		 176 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1381  spore maturation protein  43.31 
 
 		 176 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.787008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1354  spore maturation protein B  43.31 
 
 		 176 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1731  nucleoside recognition domain protein  43.03 
 
 		 181 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1353  spore maturation protein B  43.31 
 
 		 176 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.727797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1492  spore maturation protein  43.31 
 
 		 176 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4076  nucleoside recognition  49.24 
 
 		 201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  41.42 
 
 		 201 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1632  spore maturation protein  43.31 
 
 		 176 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1564  spore maturation protein  43.31 
 
 		 176 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000627549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  36.02 
 
 		 210 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000373949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2225  nucleoside recognition domain protein  39.46 
 
 		 198 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000271237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  42.07 
 
 		 176 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1526  spore maturation protein  42.68 
 
 		 176 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3819  spore maturation protein  42.68 
 
 		 176 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4200  nucleoside recognition domain protein  46.26 
 
 		 202 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.670232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0166  nucleoside recognition domain protein  42.77 
 
 		 176 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00262141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1356  nucleoside recognition  42.46 
 
 		 201 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0396  nucleoside recognition domain protein  36.32 
 
 		 198 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4225  nucleoside recognition domain protein  50.41 
 
 		 202 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  43.14 
 
 		 177 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>