93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3903 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3903  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 		 191 aa  374  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3988  nucleoside recognition domain protein  98.43 
 
 		 191 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000391988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1595  spore maturation protein A  44.75 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.325494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1563  spore maturation protein A  45.3 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000258418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1380  spore maturation protein A  45.3 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1491  spore maturation protein A  45.3 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1393  nucleoside recognition domain-containing protein  45.3 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1353  spore maturation protein A  44.75 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1352  spore maturation protein A  44.75 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.250513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1631  spore maturation protein A  44.75 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  44.2 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000554794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3820  spore maturation protein A  44.75 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000109471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1525  spore maturation protein A  44.75 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  44.2 
 
 		 210 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000373949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2225  nucleoside recognition domain protein  40.1 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000271237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  43.01 
 
 		 197 aa  164  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  42.47 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1194  nucleoside recognition domain-containing protein  44.75 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  41.71 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  44.2 
 
 		 437 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  43.98 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  41.15 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1356  nucleoside recognition  42.78 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2093  nucleoside recognition domain protein  43.41 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.752019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  41.03 
 
 		 408 aa  158  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1647  nucleoside recognition domain protein  43.09 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0396  nucleoside recognition domain protein  38.54 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  38.1 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  38.1 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  42.55 
 
 		 408 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  42.02 
 
 		 408 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  37.44 
 
 		 408 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  39.49 
 
 		 408 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  40.31 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  39.29 
 
 		 412 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  38.5 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  40.88 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  41.92 
 
 		 432 aa  148  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  40.96 
 
 		 408 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  40.96 
 
 		 408 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  40.96 
 
 		 408 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  40.96 
 
 		 408 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1198  nucleoside recognition domain-containing protein  40.53 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.499507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  40.43 
 
 		 408 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  41.49 
 
 		 408 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  39.68 
 
 		 408 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4200  nucleoside recognition domain protein  39.15 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.670232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4076  nucleoside recognition  41.38 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  37.63 
 
 		 427 aa  144  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4225  nucleoside recognition domain protein  43.21 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  39.57 
 
 		 408 aa  143  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  40.74 
 
 		 408 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  38.3 
 
 		 412 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  38.67 
 
 		 412 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  39.56 
 
 		 410 aa  139  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3908  spore maturation protein  35.6 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  38.92 
 
 		 417 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  38.92 
 
 		 417 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  41.52 
 
 		 459 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  39.8 
 
 		 419 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2857  spore maturation protein A  41.67 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  38.31 
 
 		 414 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  40.41 
 
 		 414 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2542  spore maturation protein A  41.67 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  38.27 
 
 		 419 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  36.53 
 
 		 440 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  40.93 
 
 		 414 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  38.83 
 
 		 409 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  39.89 
 
 		 409 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  33.83 
 
 		 415 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  39.89 
 
 		 409 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  33.83 
 
 		 415 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1140  nucleoside recognition domain-containing protein  41.44 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  37.23 
 
 		 409 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  37.77 
 
 		 409 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  37.23 
 
 		 413 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  37.23 
 
 		 413 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  39.76 
 
 		 409 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  37.77 
 
 		 409 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  42.48 
 
 		 423 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  36.32 
 
 		 415 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  37.77 
 
 		 409 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  36.22 
 
 		 409 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  38.46 
 
 		 409 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  36.51 
 
 		 417 aa  118  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  36.16 
 
 		 411 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  42.55 
 
 		 476 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2584  nucleoside recognition domain protein  34.55 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0491537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1253  nucleoside recognition domain protein  43.83 
 
 		 333 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  32.8 
 
 		 411 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  35.16 
 
 		 409 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  37.23 
 
 		 409 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  38.1 
 
 		 479 aa  104  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>