135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1060 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 		 440 aa  847    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  71.92 
 
 		 432 aa  580  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  63.16 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  64.68 
 
 		 459 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  47.46 
 
 		 437 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  40.05 
 
 		 419 aa  286  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  42.65 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  42.72 
 
 		 409 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  39.02 
 
 		 415 aa  276  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  38.8 
 
 		 415 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  39.41 
 
 		 409 aa  273  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  38.63 
 
 		 415 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  41.27 
 
 		 417 aa  270  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  41.04 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  36.84 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  40.14 
 
 		 413 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  39.35 
 
 		 408 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  40.14 
 
 		 413 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  40.05 
 
 		 408 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  41.39 
 
 		 409 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  38.34 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  39.76 
 
 		 409 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  36.97 
 
 		 414 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  40.19 
 
 		 409 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  37.61 
 
 		 414 aa  256  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  39.81 
 
 		 409 aa  256  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  38.96 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  38.95 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  40.1 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  40.1 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  40.1 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  39.85 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  37.44 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  35.97 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  38.85 
 
 		 408 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  38.03 
 
 		 408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  40.09 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  39.24 
 
 		 412 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  38.6 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  37.18 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  39.44 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  38.56 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  41.29 
 
 		 409 aa  236  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  37.26 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  31.16 
 
 		 479 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  58.24 
 
 		 201 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  45.5 
 
 		 197 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  52.02 
 
 		 177 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  51.16 
 
 		 178 aa  177  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  51.52 
 
 		 194 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4076  nucleoside recognition  60.13 
 
 		 201 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  54.34 
 
 		 177 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4200  nucleoside recognition domain protein  59.48 
 
 		 202 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.670232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  55.56 
 
 		 180 aa  172  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  48.55 
 
 		 173 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  46.86 
 
 		 177 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  46.86 
 
 		 177 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0346  nucleoside recognition domain-containing protein  59.06 
 
 		 179 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34329  normal  0.440444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  45.81 
 
 		 200 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1647  nucleoside recognition domain protein  46.71 
 
 		 191 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  47.09 
 
 		 194 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4225  nucleoside recognition domain protein  60.14 
 
 		 202 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0706  nucleoside recognition domain protein  50.57 
 
 		 182 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0397  nucleoside recognition domain protein  47.43 
 
 		 177 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  50 
 
 		 177 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1394  nucleoside recognition domain-containing protein  45.66 
 
 		 176 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1632  spore maturation protein  45.09 
 
 		 176 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1596  spore maturation protein  44.51 
 
 		 176 aa  163  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1381  spore maturation protein  44.51 
 
 		 176 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.787008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1354  spore maturation protein B  44.51 
 
 		 176 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1353  spore maturation protein B  44.51 
 
 		 176 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.727797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  46.63 
 
 		 201 aa  163  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  46.63 
 
 		 201 aa  163  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1492  spore maturation protein  44.51 
 
 		 176 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1195  nucleoside recognition domain-containing protein  45.66 
 
 		 176 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1526  spore maturation protein  44.51 
 
 		 176 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3819  spore maturation protein  44.51 
 
 		 176 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1564  spore maturation protein  44.51 
 
 		 176 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000627549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1731  nucleoside recognition domain protein  49.42 
 
 		 181 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1356  nucleoside recognition  49.09 
 
 		 201 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  43.35 
 
 		 176 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  46.2 
 
 		 178 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1198  nucleoside recognition domain-containing protein  50.91 
 
 		 199 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.499507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  45.36 
 
 		 197 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2093  nucleoside recognition domain protein  45.18 
 
 		 197 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.752019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  40.62 
 
 		 210 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000373949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2224  nucleoside recognition domain protein  45.14 
 
 		 177 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  42.93 
 
 		 194 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  44.51 
 
 		 176 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2225  nucleoside recognition domain protein  47.34 
 
 		 198 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000271237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  42.42 
 
 		 177 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  50.61 
 
 		 193 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11840  nucleoside recognition domain protein  42.69 
 
 		 176 aa  156  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.456869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  40.21 
 
 		 195 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000554794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0166  nucleoside recognition domain protein  45.2 
 
 		 176 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00262141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3414  nucleoside recognition domain protein  50.32 
 
 		 179 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0396  nucleoside recognition domain protein  41.62 
 
 		 198 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4077  nucleoside recognition  58.05 
 
 		 180 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1393  nucleoside recognition domain-containing protein  45.91 
 
 		 198 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  50.6 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>