93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1412 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  100 
 
 		 178 aa  352  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  65.68 
 
 		 177 aa  237  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  60.34 
 
 		 176 aa  230  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  62.07 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  58.76 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3414  nucleoside recognition domain protein  60.67 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  50.57 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1394  nucleoside recognition domain-containing protein  55.11 
 
 		 176 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1632  spore maturation protein  54.55 
 
 		 176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1381  spore maturation protein  53.98 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.787008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1564  spore maturation protein  53.98 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000627549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1596  spore maturation protein  53.98 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1492  spore maturation protein  53.98 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1353  spore maturation protein B  53.98 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.727797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1354  spore maturation protein B  53.98 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1526  spore maturation protein  53.98 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3819  spore maturation protein  53.98 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  55.62 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1195  nucleoside recognition domain-containing protein  53.98 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0397  nucleoside recognition domain protein  52.57 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2224  nucleoside recognition domain protein  52 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  52.02 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11840  nucleoside recognition domain protein  46.86 
 
 		 176 aa  188  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.456869  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  52.05 
 
 		 427 aa  185  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  50.3 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  50.3 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1731  nucleoside recognition domain protein  47.95 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0706  nucleoside recognition domain protein  55.29 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  49.14 
 
 		 437 aa  171  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  49.14 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  50 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0166  nucleoside recognition domain protein  49.11 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00262141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0346  nucleoside recognition domain-containing protein  50 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34329  normal  0.440444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  48.73 
 
 		 411 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  49.39 
 
 		 409 aa  158  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  48.7 
 
 		 419 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  46.67 
 
 		 408 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  45.86 
 
 		 419 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  48.43 
 
 		 411 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  46.2 
 
 		 440 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  49.67 
 
 		 412 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  47.33 
 
 		 408 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  47.65 
 
 		 408 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  43.93 
 
 		 415 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  45.93 
 
 		 432 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  46.67 
 
 		 408 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  46.67 
 
 		 408 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  46.67 
 
 		 408 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  48.98 
 
 		 459 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  46.67 
 
 		 408 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  46.67 
 
 		 408 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  46.67 
 
 		 408 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  46.67 
 
 		 408 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  43.93 
 
 		 415 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  43.35 
 
 		 415 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  46.98 
 
 		 412 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  44.65 
 
 		 417 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  46.15 
 
 		 423 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  44.67 
 
 		 408 aa  144  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  47.4 
 
 		 414 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  44.03 
 
 		 417 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  50.67 
 
 		 408 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4201  nucleoside recognition domain protein  50.66 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4077  nucleoside recognition  51.32 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  46.79 
 
 		 409 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4226  nucleoside recognition domain protein  50.66 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  46.15 
 
 		 409 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  48.67 
 
 		 408 aa  141  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  45.51 
 
 		 409 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2856  spore maturation protein B  43.87 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2541  spore maturation protein B  43.87 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  44.97 
 
 		 414 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  42.31 
 
 		 410 aa  137  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  43.31 
 
 		 414 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  48 
 
 		 408 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  46.25 
 
 		 412 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  45.28 
 
 		 417 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  44.23 
 
 		 409 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  42.95 
 
 		 413 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  43.59 
 
 		 409 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  44.23 
 
 		 409 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  42.31 
 
 		 413 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  43.59 
 
 		 409 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  41.67 
 
 		 409 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  43.59 
 
 		 409 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3907  nucleoside recognition domain-containing protein  38.69 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  40.51 
 
 		 409 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3987  spore maturation protein B  44.08 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000757756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3902  spore maturation protein B  42.11 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  43.04 
 
 		 409 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  40.94 
 
 		 476 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  39.6 
 
 		 479 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2583  nucleoside recognition domain protein  33.12 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.225251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>