133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1584 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  79.9 
 
 
408 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
408 aa  801    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  79.17 
 
 
408 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  79.41 
 
 
408 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  82.11 
 
 
408 aa  688    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  80.15 
 
 
408 aa  653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  82.6 
 
 
408 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  79.9 
 
 
408 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  81.37 
 
 
408 aa  627  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  79.9 
 
 
408 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  79.17 
 
 
408 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  79.17 
 
 
408 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  78.19 
 
 
408 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  75.98 
 
 
408 aa  614  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  74.75 
 
 
412 aa  598  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  77.21 
 
 
412 aa  596  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  61.59 
 
 
409 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  57.95 
 
 
412 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  58.01 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  58.01 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  58.64 
 
 
409 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  57.7 
 
 
409 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  58.64 
 
 
409 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  57.52 
 
 
409 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  58.25 
 
 
409 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  57.18 
 
 
409 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  56.69 
 
 
409 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  56.69 
 
 
409 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  57.18 
 
 
409 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  59.71 
 
 
409 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  59.41 
 
 
409 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  49.39 
 
 
419 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  49.64 
 
 
414 aa  398  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  51.09 
 
 
414 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  48.28 
 
 
411 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  48.3 
 
 
415 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  47.67 
 
 
419 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  48.3 
 
 
415 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  48.18 
 
 
415 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  51.21 
 
 
414 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  51.09 
 
 
417 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  51.09 
 
 
417 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  47.07 
 
 
410 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  45.97 
 
 
411 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  43.71 
 
 
423 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  49.39 
 
 
417 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  40.79 
 
 
427 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  38.39 
 
 
437 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  37.59 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  41.21 
 
 
432 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  36.03 
 
 
479 aa  257  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  39.49 
 
 
440 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  47.87 
 
 
200 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  43.62 
 
 
195 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000554794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  44.97 
 
 
210 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000373949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  43.81 
 
 
201 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  43.81 
 
 
201 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  43.59 
 
 
194 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  44.16 
 
 
459 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  50.67 
 
 
178 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1356  nucleoside recognition  42.27 
 
 
201 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2225  nucleoside recognition domain protein  40.93 
 
 
198 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000271237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  38.31 
 
 
194 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  42.13 
 
 
193 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  46.51 
 
 
177 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  46.51 
 
 
177 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  38.12 
 
 
197 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  40.11 
 
 
197 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  45.56 
 
 
201 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  49.07 
 
 
177 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0396  nucleoside recognition domain protein  40.93 
 
 
198 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1647  nucleoside recognition domain protein  39.09 
 
 
191 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  49.03 
 
 
177 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3903  nucleoside recognition domain protein  39.49 
 
 
191 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3414  nucleoside recognition domain protein  45.45 
 
 
179 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  46.34 
 
 
176 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  40.21 
 
 
194 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3988  nucleoside recognition domain protein  38.97 
 
 
191 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000391988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4200  nucleoside recognition domain protein  53.73 
 
 
202 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.670232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  46 
 
 
177 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4076  nucleoside recognition  53.73 
 
 
201 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4225  nucleoside recognition domain protein  55.12 
 
 
202 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  44.81 
 
 
176 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1198  nucleoside recognition domain-containing protein  39.89 
 
 
199 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.499507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1595  spore maturation protein A  42.69 
 
 
198 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.325494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  47.17 
 
 
180 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  46.15 
 
 
178 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1380  spore maturation protein A  42.11 
 
 
198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1491  spore maturation protein A  42.11 
 
 
198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1194  nucleoside recognition domain-containing protein  42.69 
 
 
198 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1525  spore maturation protein A  42.11 
 
 
198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3820  spore maturation protein A  42.11 
 
 
198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000109471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1563  spore maturation protein A  42.11 
 
 
198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000258418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1393  nucleoside recognition domain-containing protein  41.52 
 
 
198 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1353  spore maturation protein A  41.52 
 
 
198 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1352  spore maturation protein A  41.52 
 
 
198 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.250513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1631  spore maturation protein A  41.52 
 
 
198 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  46.75 
 
 
173 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1381  spore maturation protein  44.51 
 
 
176 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.787008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1354  spore maturation protein B  44.51 
 
 
176 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>