133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0012 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
417 aa  796    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  99.28 
 
 
417 aa  791    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  82.25 
 
 
417 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  66.59 
 
 
414 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  65.86 
 
 
414 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  61.52 
 
 
419 aa  508  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  61.34 
 
 
414 aa  500  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  62.71 
 
 
415 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  62.71 
 
 
415 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  62.98 
 
 
415 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  55.66 
 
 
419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  54.37 
 
 
412 aa  425  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  54.01 
 
 
408 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  52.07 
 
 
408 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  51.7 
 
 
408 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  51.46 
 
 
408 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  51.21 
 
 
408 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  51.21 
 
 
408 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  51.46 
 
 
408 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  47.61 
 
 
410 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  50.36 
 
 
409 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  49.88 
 
 
409 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  50.61 
 
 
408 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  51.08 
 
 
408 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  51.33 
 
 
408 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  50.36 
 
 
412 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  51.33 
 
 
408 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  50.84 
 
 
408 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  51.09 
 
 
408 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  50.73 
 
 
409 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  45.06 
 
 
411 aa  359  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  45.82 
 
 
411 aa  359  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  49 
 
 
412 aa  358  8e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  48.3 
 
 
409 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  49.76 
 
 
409 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  48.06 
 
 
413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  47.82 
 
 
413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  48.06 
 
 
409 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  46.99 
 
 
409 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  48.19 
 
 
408 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  50.6 
 
 
409 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  44.26 
 
 
423 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  47.33 
 
 
409 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  47.57 
 
 
409 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  47.57 
 
 
409 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  51.51 
 
 
409 aa  342  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  41.18 
 
 
427 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  44.06 
 
 
432 aa  289  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  37.84 
 
 
437 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  41.34 
 
 
440 aa  259  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  36.27 
 
 
476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  36.07 
 
 
479 aa  232  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  44.17 
 
 
459 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  43.14 
 
 
200 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  39.23 
 
 
194 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  39.13 
 
 
195 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000554794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  52.25 
 
 
201 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  39.13 
 
 
201 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  39.13 
 
 
201 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  43.9 
 
 
197 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  42.68 
 
 
177 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  48.37 
 
 
180 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  47.06 
 
 
178 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  43.54 
 
 
194 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  44.65 
 
 
178 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1647  nucleoside recognition domain protein  40.39 
 
 
191 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1731  nucleoside recognition domain protein  45.86 
 
 
181 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  38.27 
 
 
210 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000373949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2093  nucleoside recognition domain protein  46.25 
 
 
197 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.752019 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  45.7 
 
 
177 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  45.7 
 
 
177 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1198  nucleoside recognition domain-containing protein  42.11 
 
 
199 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.499507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4200  nucleoside recognition domain protein  63.79 
 
 
202 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.670232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4225  nucleoside recognition domain protein  63.79 
 
 
202 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  47.37 
 
 
177 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3988  nucleoside recognition domain protein  38.92 
 
 
191 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000391988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4076  nucleoside recognition  62.93 
 
 
201 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  45.89 
 
 
177 aa  139  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  48.99 
 
 
177 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0706  nucleoside recognition domain protein  50.34 
 
 
182 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  47.1 
 
 
197 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3903  nucleoside recognition domain protein  38.92 
 
 
191 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  45.64 
 
 
173 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0397  nucleoside recognition domain protein  43.67 
 
 
177 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  43.31 
 
 
194 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  44.52 
 
 
176 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2224  nucleoside recognition domain protein  42.68 
 
 
177 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  43.33 
 
 
193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  44.52 
 
 
176 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11840  nucleoside recognition domain protein  39.61 
 
 
176 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.456869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1595  spore maturation protein A  40.74 
 
 
198 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.325494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3414  nucleoside recognition domain protein  43.15 
 
 
179 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2225  nucleoside recognition domain protein  41.36 
 
 
198 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000271237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0396  nucleoside recognition domain protein  47.48 
 
 
198 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1380  spore maturation protein A  40.12 
 
 
198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1491  spore maturation protein A  40.12 
 
 
198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1394  nucleoside recognition domain-containing protein  40 
 
 
176 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1563  spore maturation protein A  40.12 
 
 
198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000258418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3820  spore maturation protein A  39.51 
 
 
198 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000109471 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1492  spore maturation protein  38.65 
 
 
176 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>