94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1252 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1252  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 		 180 aa  348  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  55.17 
 
 		 427 aa  187  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0706  nucleoside recognition domain protein  58.68 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0626  hypothetical protein  50.29 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0609  hypothetical protein  50.29 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  54.3 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  50.88 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1646  nucleoside recognition domain protein  44.25 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0064  nucleoside recognition domain-containing protein  46.24 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000655497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1412  nucleoside recognition proteinn  46.55 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0809763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1394  nucleoside recognition domain-containing protein  45.4 
 
 		 176 aa  170  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1632  spore maturation protein  44.83 
 
 		 176 aa  170  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1381  spore maturation protein  44.25 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.787008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1354  spore maturation protein B  44.25 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1353  spore maturation protein B  44.25 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.727797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1596  spore maturation protein  44.25 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1492  spore maturation protein  44.25 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1564  spore maturation protein  44.25 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000627549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  52.87 
 
 		 440 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1195  nucleoside recognition domain-containing protein  44.25 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1526  spore maturation protein  44.25 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3819  spore maturation protein  44.25 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  47.13 
 
 		 437 aa  163  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1731  nucleoside recognition domain protein  46.24 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  44.83 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0397  nucleoside recognition domain protein  43.1 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11840  nucleoside recognition domain protein  44.38 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.456869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  41.62 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2224  nucleoside recognition domain protein  42.77 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2098  nucleoside recognition  45.71 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000183631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0346  nucleoside recognition domain-containing protein  50.99 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34329  normal  0.440444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1197  nucleoside recognition domain-containing protein  45.09 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.966368  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  50.32 
 
 		 414 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  47.02 
 
 		 408 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  45.56 
 
 		 411 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  50.34 
 
 		 459 aa  154  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  48.48 
 
 		 413 aa  154  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  47.56 
 
 		 419 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  47.88 
 
 		 413 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  51.63 
 
 		 412 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  45.51 
 
 		 408 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  47.17 
 
 		 414 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  51.37 
 
 		 414 aa  151  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  46.06 
 
 		 409 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  47.27 
 
 		 409 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  51.46 
 
 		 432 aa  151  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  48.48 
 
 		 409 aa  150  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  48.48 
 
 		 409 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  47.2 
 
 		 409 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  46.58 
 
 		 409 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  46.82 
 
 		 409 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  45.88 
 
 		 409 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  48.37 
 
 		 417 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  48.15 
 
 		 409 aa  148  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  43.87 
 
 		 408 aa  148  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  41.81 
 
 		 411 aa  148  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  46.34 
 
 		 415 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  47.2 
 
 		 409 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  47.71 
 
 		 417 aa  147  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  46.34 
 
 		 415 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  43.51 
 
 		 419 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  43.79 
 
 		 408 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3414  nucleoside recognition domain protein  45.81 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  43.51 
 
 		 408 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  40.98 
 
 		 410 aa  145  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  43.51 
 
 		 408 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  44.81 
 
 		 412 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  40.66 
 
 		 408 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  40.66 
 
 		 408 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  42.6 
 
 		 408 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  42.6 
 
 		 408 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  46.25 
 
 		 409 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  42.01 
 
 		 408 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  45.12 
 
 		 415 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0166  nucleoside recognition domain protein  43.1 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00262141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  44.83 
 
 		 417 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  47.88 
 
 		 409 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3902  spore maturation protein B  43.86 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3987  spore maturation protein B  45.03 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000757756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  40.83 
 
 		 412 aa  134  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4077  nucleoside recognition  52.32 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4226  nucleoside recognition domain protein  51.66 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4201  nucleoside recognition domain protein  51.66 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  47.56 
 
 		 408 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  46.75 
 
 		 408 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  43.26 
 
 		 408 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  36.94 
 
 		 423 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2541  spore maturation protein B  41.03 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2856  spore maturation protein B  41.03 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  36.18 
 
 		 479 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3907  nucleoside recognition domain-containing protein  34.16 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2583  nucleoside recognition domain protein  35.29 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.225251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  33.33 
 
 		 476 aa  94.4  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1336  hypothetical protein  31.63 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>