More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1472 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  44.7 
 
 
308 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  43.71 
 
 
308 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  44.78 
 
 
310 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  41.89 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  44.97 
 
 
291 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  40.64 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  40.27 
 
 
307 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  38.98 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 
305 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  39.16 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 
312 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
322 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  37.65 
 
 
331 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 
308 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 
318 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 
310 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 
308 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 
318 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.8 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.57 
 
 
312 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 
325 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 
301 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  30.13 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  36.65 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  32.03 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  33.74 
 
 
330 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 
305 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 
310 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  33.73 
 
 
302 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 
297 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
361 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  25.8 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  30.4 
 
 
318 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  25.89 
 
 
326 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  30.23 
 
 
323 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 
306 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  25.53 
 
 
326 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  29.77 
 
 
323 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  25.53 
 
 
323 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  25.53 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  25.53 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  38.51 
 
 
308 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
296 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
306 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 
266 aa  105  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
333 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  31.19 
 
 
320 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
266 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 
306 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
267 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  30.26 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 
264 aa  94  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 
259 aa  87  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
267 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  24.32 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  22.97 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 
208 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  22.27 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.98 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  28.74 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  22.42 
 
 
228 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
252 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  32.31 
 
 
348 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  24.63 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  22.77 
 
 
228 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  26.42 
 
 
213 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  22.77 
 
 
228 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  22.77 
 
 
228 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  38.62 
 
 
215 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  35.33 
 
 
243 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0543  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
263 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
355 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  32.16 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  29.63 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
232 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
234 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  21.82 
 
 
228 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>