More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0676 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  62.99 
 
 		 126 aa  179  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  64.57 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  60.63 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  61.42 
 
 		 125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  60.63 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  57.48 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  58.27 
 
 		 127 aa  157  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 		 127 aa  157  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  60 
 
 		 127 aa  157  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 127 aa  156  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  59.84 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  59.2 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  59.2 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 126 aa  151  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  57.94 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  60.66 
 
 		 126 aa  150  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  55.12 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 127 aa  150  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 126 aa  149  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  53.97 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  54.33 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 132 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  55.12 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  52.76 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 140 aa  129  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  55.46 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  44.26 
 
 		 160 aa  126  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>