72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6473 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
293 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  80 
 
 
299 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  58.3 
 
 
298 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  45.79 
 
 
293 aa  233  2e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  44.91 
 
 
444 aa  231  7e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  45.79 
 
 
293 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
317 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  43.35 
 
 
317 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  43.88 
 
 
395 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  42.91 
 
 
293 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  43.53 
 
 
404 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  43.68 
 
 
404 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  43.68 
 
 
404 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  43.68 
 
 
404 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  43.68 
 
 
486 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  43.68 
 
 
395 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 
293 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  41.01 
 
 
299 aa  222  5e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  43 
 
 
289 aa  222  5e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  41.85 
 
 
303 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  46.18 
 
 
295 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  41.44 
 
 
295 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  41.44 
 
 
295 aa  221  1e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  1.47175e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  41.01 
 
 
299 aa  221  1e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  41.44 
 
 
295 aa  221  1e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  45.78 
 
 
295 aa  219  4e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  44.98 
 
 
293 aa  219  4e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  40.65 
 
 
299 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  44.57 
 
 
299 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 
294 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 
291 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  39.85 
 
 
291 aa  214  1e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  41.13 
 
 
291 aa  214  1e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  44.49 
 
 
291 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  41.37 
 
 
287 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  38.87 
 
 
299 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  42.21 
 
 
292 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 
307 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 
307 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 
307 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  39.18 
 
 
307 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 
283 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 
307 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.44 
 
 
296 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  36.9 
 
 
304 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  35.49 
 
 
288 aa  188  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  35.84 
 
 
292 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  34.81 
 
 
288 aa  183  4e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 
266 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
273 aa  135  7e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  29.55 
 
 
273 aa  134  2e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.46635e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  29.17 
 
 
293 aa  133  4e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
292 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  31.23 
 
 
302 aa  113  4e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  3.15394e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
526 aa  62.8  6e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 
274 aa  58.9  1e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  24.35 
 
 
301 aa  55.8  8e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.87 
 
 
298 aa  50.4  3e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  22.66 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  23.5 
 
 
291 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  1.02654e-05 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 
318 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 
312 aa  45.8  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.62 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  31.46 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  22.66 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  22.44 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  22.84 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  24.81 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  21.98 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>